Caracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositol

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Mariana Santos Cardoso
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/BUOS-9FDFF6
Resumo: Glicosilfosfatidilinositol (GPI) é a estrutura predominante das âncoras utilizadas pelo Trypanosoma cruzi para expressar proteínas em sua superfície, muitas delas essenciais para a virulência do parasito ou para seu escape da resposta imune do hospedeiro. Além disso, âncoras GPI de T. cruzi exercem atividades imunoestimulatórias e regulatórias, incluindo a indução da síntese de citocinas pró-inflamatórias por macrófagos do hospedeiro. Portanto, os genes codificadores de enzimas e outros fatores envolvidos na biossíntese de âncoras GPI de T. cruzi são alvos potencialmente atrativos para o desenvolvimento de novas drogas contra a doença causada pelo parasito, conhecida como doença de Chagas. Assim, o objetivo desse projeto foi investigar a via de biossíntese das âncoras GPI, por meio da caracterização bioquímica e funcional dos genes que codificam os componentes dessa via. Para isso, as sequências desses genes, obtidas em bancos de dados do genoma do T. cruzi, foram analisadas e os produtos desses genes avaliados por (i) complementação heteróloga em mutantes condicionalmente letais de Saccharomyces cerevisiae, (ii) ensaios de expressão gênica bem como de localização celular no parasito e (iiii) análise do fenótipo de parasitos nocautes para alguns desses genes. As análises in silico das sequências disponíveis no banco de dados do genoma do T. cruzi (TriTrypDB) resultaram na identificação de 18 genes que codificam proteínas da via de biossíntese de GPI, bem como do gene da inositolfosforilceramida sintase (IPCS). Sequências correspondentes aos genes TcDPM1, TcGPI3 e TcGPI12 de T. cruzi, expressas em epimastigotas em fusão com GFP, apresentaram uma localização celular compatível com o retículo endoplasmático. Análises dos níveis de RNA de TcGPI8 e TcGPI10 indicaram um aumento da expressão em epimastigotas e amastigotas, os dois estágios proliferativos do parasito. Análises de leveduras deficientes em vários genes da via biossintética de GPI e transformadas com os respectivos genes de T. cruzi mostraram que os genes TcDPM1, TcGPI10 e TcGPI12 foram capazes de restaurar o crescimento desses mutantes em condições não permissivas, indicando que essas proteínas são homólogas às de leveduras. Proteínas recombinantes foram também obtidas em bactérias com o objetivo de desenvolver estudos sobre suas estruturas. Para investigar o papel de proteínas ancoradas a GPI de T. cruzi, o gene TcGPI8, que codifica a subunidade catalítica do complexo que catalisa a última etapa da via, foi deletado. Apesar de terem sido gerados parasitos apresentando um dos alelos deletados, nos quais a diminuição nos níveis de expressão dos mRNAs de TcGPI8 foi observada, várias tentativas de deletar o segundo alelo de TcGPI8 resultaram em parasitos com a inserção dos genes de resistência a droga nos dois alelos, mas que apresentavam rearranjos no genoma e, em consequência, ainda expressavam o mRNA de GPI8. A caracterização desses parasitos mutantes de TcGPI8 indicou que, apesar deles apresentarem somente pequenas alterações na composição do glicocálix, os efeitos dessas alterações na sua capacidade infectiva foram bastante evidentes. Dessa forma, além de aprofundar o conhecimento sobre os componentes da via de biossíntese de âncoras GPI, que parece ser essencial para a sobrevivência do parasito, o presente trabalho possibilitou a geração de mutantes de leveduras complementados com genes ortólogos de T. cruzi, os quais se tornam valiosas ferramentas a serem utilizadas em ensaios de screening em larga escala para a descoberta de novas drogas para o tratamento da doença de Chagas.
id UFMG_6e157b9a39e76697abe875a14275c019
oai_identifier_str oai:repositorio.ufmg.br:1843/BUOS-9FDFF6
network_acronym_str UFMG
network_name_str Repositório Institucional da UFMG
repository_id_str
spelling Santuza Maria Ribeiro TeixeiraRicardo Tostes GazzinelliSergio SchenkmanNorton HeiseAlexandre Ferreira MarquesCarlos Renato MachadoMariana Santos Cardoso2019-08-10T07:57:32Z2019-08-10T07:57:32Z2013-08-26http://hdl.handle.net/1843/BUOS-9FDFF6Glicosilfosfatidilinositol (GPI) é a estrutura predominante das âncoras utilizadas pelo Trypanosoma cruzi para expressar proteínas em sua superfície, muitas delas essenciais para a virulência do parasito ou para seu escape da resposta imune do hospedeiro. Além disso, âncoras GPI de T. cruzi exercem atividades imunoestimulatórias e regulatórias, incluindo a indução da síntese de citocinas pró-inflamatórias por macrófagos do hospedeiro. Portanto, os genes codificadores de enzimas e outros fatores envolvidos na biossíntese de âncoras GPI de T. cruzi são alvos potencialmente atrativos para o desenvolvimento de novas drogas contra a doença causada pelo parasito, conhecida como doença de Chagas. Assim, o objetivo desse projeto foi investigar a via de biossíntese das âncoras GPI, por meio da caracterização bioquímica e funcional dos genes que codificam os componentes dessa via. Para isso, as sequências desses genes, obtidas em bancos de dados do genoma do T. cruzi, foram analisadas e os produtos desses genes avaliados por (i) complementação heteróloga em mutantes condicionalmente letais de Saccharomyces cerevisiae, (ii) ensaios de expressão gênica bem como de localização celular no parasito e (iiii) análise do fenótipo de parasitos nocautes para alguns desses genes. As análises in silico das sequências disponíveis no banco de dados do genoma do T. cruzi (TriTrypDB) resultaram na identificação de 18 genes que codificam proteínas da via de biossíntese de GPI, bem como do gene da inositolfosforilceramida sintase (IPCS). Sequências correspondentes aos genes TcDPM1, TcGPI3 e TcGPI12 de T. cruzi, expressas em epimastigotas em fusão com GFP, apresentaram uma localização celular compatível com o retículo endoplasmático. Análises dos níveis de RNA de TcGPI8 e TcGPI10 indicaram um aumento da expressão em epimastigotas e amastigotas, os dois estágios proliferativos do parasito. Análises de leveduras deficientes em vários genes da via biossintética de GPI e transformadas com os respectivos genes de T. cruzi mostraram que os genes TcDPM1, TcGPI10 e TcGPI12 foram capazes de restaurar o crescimento desses mutantes em condições não permissivas, indicando que essas proteínas são homólogas às de leveduras. Proteínas recombinantes foram também obtidas em bactérias com o objetivo de desenvolver estudos sobre suas estruturas. Para investigar o papel de proteínas ancoradas a GPI de T. cruzi, o gene TcGPI8, que codifica a subunidade catalítica do complexo que catalisa a última etapa da via, foi deletado. Apesar de terem sido gerados parasitos apresentando um dos alelos deletados, nos quais a diminuição nos níveis de expressão dos mRNAs de TcGPI8 foi observada, várias tentativas de deletar o segundo alelo de TcGPI8 resultaram em parasitos com a inserção dos genes de resistência a droga nos dois alelos, mas que apresentavam rearranjos no genoma e, em consequência, ainda expressavam o mRNA de GPI8. A caracterização desses parasitos mutantes de TcGPI8 indicou que, apesar deles apresentarem somente pequenas alterações na composição do glicocálix, os efeitos dessas alterações na sua capacidade infectiva foram bastante evidentes. Dessa forma, além de aprofundar o conhecimento sobre os componentes da via de biossíntese de âncoras GPI, que parece ser essencial para a sobrevivência do parasito, o presente trabalho possibilitou a geração de mutantes de leveduras complementados com genes ortólogos de T. cruzi, os quais se tornam valiosas ferramentas a serem utilizadas em ensaios de screening em larga escala para a descoberta de novas drogas para o tratamento da doença de Chagas.Glycosylphosphatidylinositol (GPI) is the predominant structure that Trypanosoma cruzi uses to anchor proteins on its surface, many of them essential for the virulence of the parasite or its escape from the host immune response. Furthermore, T. cruzi GPI anchors exert immunostimulatory and regulatory activities, including the induction of pro-inflammatory cytokines synthesis by host macrophages. Therefore, genes encoding enzymes and other factors involved in the T. cruzi GPI biosynthetic pathway are potentially attractive targets for the development of new drugs against the disease caused by parasite, known as Chagas disease. The aim of this project was to investigate the T. cruzi GPI biosynthetic pathway, through biochemical and functional characterization of genes encoding components of this pathway. Thus, DNA sequences obtained from T. cruzi genome database were analyzed and their gene products evaluated by (i) heterologous complementation in conditional lethal mutants of Saccharomyces cerevisiae, (ii) gene expression assays as well as cellular localization in the parasite, and (iii) analysis of the phenotype of knockout parasites for some of these genes. In silico analyses of sequences available in the T. cruzi genome database (TriTrypDB) resulted in the identification of 18 genes encoding GPI biosynthesis proteins as well as inositol phosphorylceramide synthase gene (IPCS). T. cruzi sequences corresponding to TcDPM1, TcGPI3, and TcGPI12 genes, expressed in epimastigotes as GFP-fusion proteins, showed a cellular localization compatible with the endoplasmic reticulum. Analyses of RNA levels of TcGPI8 and TcGPI10 showed increased expression in epimastigotes and amastigotes, the two proliferative stages of the parasite. Yeasts defective in various genes of the GPI biosynthetic pathway, transformed with the respective T. cruzi genes were analyzed. We showed that TcDPM1, TcGPI10, and TcGPI12 genes were able to restore the growth of yeast mutants in non-permissive conditions, indicating that these proteins are homologous to yeast proteins. Recombinant proteins were also obtained in bacteria with the objective of developing studies about their structures. To investigate the role of GPI anchored proteins of T. cruzi, we disrupt the TcGPI8 gene, which encodes the complex catalytic subunit that catalyzes the last step of the pathway. Although we were able to generate parasites presenting one TcGPI8 allele deleted, in which TcGPI8 mRNA levels were reduced, several attempts to delete the second TcGPI8 allele resulted in parasites with the insertion of drugs resistance genes in the two alleles, but showing genome rearrangements and, consequently, still expressing the TcGPI8 mRNA. The characterization of these TcGPI8 mutant parasites showed that, although they present only minor changes in the glycocalyx composition, the effects of these changes on their infective capacity were quite evident. Therefore, besides deepening the knowledge about the components of the GPI anchors biosynthesis, which appears to be essential for the parasite survival, this work resulted in the generation of yeast mutants complemented with T. cruzi orthologous genes, which now became valuable tools to be used in high throughput screening assays that may led to the discovery of new drugs for the treatment of Chagas disease.Universidade Federal de Minas GeraisUFMGTripanossoma cruziBioquímicaBiossínteseGlicosilfosfatidilinositolBioquímica e ImunologiaCaracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositolinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFMGinstname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)instacron:UFMGORIGINALtese_mariana_santos_cardoso.pdfapplication/pdf12423885https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUOS-9FDFF6/1/tese_mariana_santos_cardoso.pdf5826120557751f1d55c2983e70b27b8eMD51TEXTtese_mariana_santos_cardoso.pdf.txttese_mariana_santos_cardoso.pdf.txtExtracted texttext/plain303759https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUOS-9FDFF6/2/tese_mariana_santos_cardoso.pdf.txt7af04c0a9a6d973469af831ec8e17e2aMD521843/BUOS-9FDFF62019-11-14 03:16:34.687oai:repositorio.ufmg.br:1843/BUOS-9FDFF6Repositório de PublicaçõesPUBhttps://repositorio.ufmg.br/oaiopendoar:2019-11-14T06:16:34Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Caracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositol
title Caracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositol
spellingShingle Caracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositol
Mariana Santos Cardoso
Bioquímica e Imunologia
Tripanossoma cruzi
Bioquímica
Biossíntese
Glicosilfosfatidilinositol
title_short Caracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositol
title_full Caracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositol
title_fullStr Caracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositol
title_full_unstemmed Caracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositol
title_sort Caracterização de genes de Trypanosoma cruzi envolvidos na via de biossíntese de glicosilfosfatidilinositol
author Mariana Santos Cardoso
author_facet Mariana Santos Cardoso
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Santuza Maria Ribeiro Teixeira
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Ricardo Tostes Gazzinelli
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Sergio Schenkman
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Norton Heise
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Alexandre Ferreira Marques
dc.contributor.referee4.fl_str_mv Carlos Renato Machado
dc.contributor.author.fl_str_mv Mariana Santos Cardoso
contributor_str_mv Santuza Maria Ribeiro Teixeira
Ricardo Tostes Gazzinelli
Sergio Schenkman
Norton Heise
Alexandre Ferreira Marques
Carlos Renato Machado
dc.subject.por.fl_str_mv Bioquímica e Imunologia
topic Bioquímica e Imunologia
Tripanossoma cruzi
Bioquímica
Biossíntese
Glicosilfosfatidilinositol
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Tripanossoma cruzi
Bioquímica
Biossíntese
Glicosilfosfatidilinositol
description Glicosilfosfatidilinositol (GPI) é a estrutura predominante das âncoras utilizadas pelo Trypanosoma cruzi para expressar proteínas em sua superfície, muitas delas essenciais para a virulência do parasito ou para seu escape da resposta imune do hospedeiro. Além disso, âncoras GPI de T. cruzi exercem atividades imunoestimulatórias e regulatórias, incluindo a indução da síntese de citocinas pró-inflamatórias por macrófagos do hospedeiro. Portanto, os genes codificadores de enzimas e outros fatores envolvidos na biossíntese de âncoras GPI de T. cruzi são alvos potencialmente atrativos para o desenvolvimento de novas drogas contra a doença causada pelo parasito, conhecida como doença de Chagas. Assim, o objetivo desse projeto foi investigar a via de biossíntese das âncoras GPI, por meio da caracterização bioquímica e funcional dos genes que codificam os componentes dessa via. Para isso, as sequências desses genes, obtidas em bancos de dados do genoma do T. cruzi, foram analisadas e os produtos desses genes avaliados por (i) complementação heteróloga em mutantes condicionalmente letais de Saccharomyces cerevisiae, (ii) ensaios de expressão gênica bem como de localização celular no parasito e (iiii) análise do fenótipo de parasitos nocautes para alguns desses genes. As análises in silico das sequências disponíveis no banco de dados do genoma do T. cruzi (TriTrypDB) resultaram na identificação de 18 genes que codificam proteínas da via de biossíntese de GPI, bem como do gene da inositolfosforilceramida sintase (IPCS). Sequências correspondentes aos genes TcDPM1, TcGPI3 e TcGPI12 de T. cruzi, expressas em epimastigotas em fusão com GFP, apresentaram uma localização celular compatível com o retículo endoplasmático. Análises dos níveis de RNA de TcGPI8 e TcGPI10 indicaram um aumento da expressão em epimastigotas e amastigotas, os dois estágios proliferativos do parasito. Análises de leveduras deficientes em vários genes da via biossintética de GPI e transformadas com os respectivos genes de T. cruzi mostraram que os genes TcDPM1, TcGPI10 e TcGPI12 foram capazes de restaurar o crescimento desses mutantes em condições não permissivas, indicando que essas proteínas são homólogas às de leveduras. Proteínas recombinantes foram também obtidas em bactérias com o objetivo de desenvolver estudos sobre suas estruturas. Para investigar o papel de proteínas ancoradas a GPI de T. cruzi, o gene TcGPI8, que codifica a subunidade catalítica do complexo que catalisa a última etapa da via, foi deletado. Apesar de terem sido gerados parasitos apresentando um dos alelos deletados, nos quais a diminuição nos níveis de expressão dos mRNAs de TcGPI8 foi observada, várias tentativas de deletar o segundo alelo de TcGPI8 resultaram em parasitos com a inserção dos genes de resistência a droga nos dois alelos, mas que apresentavam rearranjos no genoma e, em consequência, ainda expressavam o mRNA de GPI8. A caracterização desses parasitos mutantes de TcGPI8 indicou que, apesar deles apresentarem somente pequenas alterações na composição do glicocálix, os efeitos dessas alterações na sua capacidade infectiva foram bastante evidentes. Dessa forma, além de aprofundar o conhecimento sobre os componentes da via de biossíntese de âncoras GPI, que parece ser essencial para a sobrevivência do parasito, o presente trabalho possibilitou a geração de mutantes de leveduras complementados com genes ortólogos de T. cruzi, os quais se tornam valiosas ferramentas a serem utilizadas em ensaios de screening em larga escala para a descoberta de novas drogas para o tratamento da doença de Chagas.
publishDate 2013
dc.date.issued.fl_str_mv 2013-08-26
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-08-10T07:57:32Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-08-10T07:57:32Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1843/BUOS-9FDFF6
url http://hdl.handle.net/1843/BUOS-9FDFF6
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFMG
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFMG
instname:Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron:UFMG
instname_str Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
instacron_str UFMG
institution UFMG
reponame_str Repositório Institucional da UFMG
collection Repositório Institucional da UFMG
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUOS-9FDFF6/1/tese_mariana_santos_cardoso.pdf
https://repositorio.ufmg.br/bitstream/1843/BUOS-9FDFF6/2/tese_mariana_santos_cardoso.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 5826120557751f1d55c2983e70b27b8e
7af04c0a9a6d973469af831ec8e17e2a
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801676817501782016