Caracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ikeda, Angela Cristina
Data de Publicação: 2010
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/22808
Resumo: Orientadora : Lygia Vitória Galli Terasawa
id UFPR_af4abfdb315d9d59d34d417f8600117b
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/22808
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Hungria, Mariangela, 1958-Steffens, Maria Berenice Reynaud, 1963-2021Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaGalli-Terasawa, Lygia VitóriaIkeda, Angela Cristina2022-11-25T18:21:00Z2022-11-25T18:21:00Z2010https://hdl.handle.net/1884/22808Orientadora : Lygia Vitória Galli TerasawaCo-Orientadoras: Prof. Mariangela Hungria e Profa. Maria Berenice Reynaud SteffensDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba,25/02/2010Bibliografia: fls.78-86Área de concentração: GenéticaResumo: A cultura do milho (Zea mays L.) tem relevante expressão no cenário mundial e o Estado do Paraná desempenha importante papel como maior produtor de milho no Brasil. Assim, todas as estratégias que permitam otimizar a produção deste importante cultivo são importantes para a pesquisa aplicada. Bactérias endofíticas apresentam alto potencial na elevação dos índices de produtividade, por mecanismos como a fixação biológica do nitrogênio , a promoção do crescimento de plantas pela produção de fitohormônios, o controle de patógenos, entre outros. O presente trabalho tem como objetivos isolar bactérias que se associam endofiticamente com diferentes genótipos de milho (linhagens e híbridos) e caracterizá-las quanto a diversas propriedades morfofisiológicas e genéticas. Para isso, incialmente foi estabelecida uma coleção de 217 isolados de bactérias endofíticas de raízes de milho e destes, 98 foram mantidos em condições de laboratório. Foram realizadas caracterizações morfofisiológicas, incluindo morfologia de colônias, diversos testes bioquímicos (crescimento em diferentes meios de cultura, redução do nitrato, urease, catalase, tolerância intrínseca a antibióticos) e avaliação da capacidade de fixação do nitrogênio "in vitro". omo etapa subsequente, avaliou-se o perfil genético das bactérias através da amplificação do DNA com o "primer" BOX-PCR, relacionado a regiões repetitivas e não codificantes do DNA. Foi realizado, ainda, o sequenciamento parcial do gene 16S RNAr de bactérias representantes dos principais agrupamentos obtidos com os dados morfofisiológicos, sendo identificados os gêneros Pantoea, Bacillus, Burkholderia e Klebsiella. Constatou-se alta variabilidade entre os isolados obtidos em todos os p râmetros analisados, confirmando que populações com elevado grau de diversidade morfofisiológica e genética se estabelece endofiticamente com o milho. É interessante constatar que essa diversidade ocorre mesmo em linhagens e híbridos de milho obtidos em condições normais de melhoramento para a gramínea, que não consideram a capacidade de associação com bactérias endofíticas. O estabelecimento dessa importante coleção, com microrganismos pertencentes a gêneros pouco estudados com a cultura do milho no Brasil permitirá a ondução de estudos para a avaliação da capacidade promotora de crescimento ou de controle biológico dessas bactérias.Abstract: Maize (Zea mays L.) has a relevant expression in the world and the State of Parana plays an important role as the largest producer of corn in Brazil. Thus, all strategies to optimize the production of this important crop are important for applied research. Endophytic bacteria have a high potential for raising levels of productivity, by mechanisms such as biological nitrogen fixation, growth promotion of plants by the production of phyto-hormones, the control of pathogens, among others. This work aims to isolate bacteria that are associated with different endophyte genotypes of maize (lineages and hybrid) and characterize them as a number of morphophysiological and genetic properties. So, it was initially established a collection of 217 isolates of endophytic bacteria from roots of maize and 98 isolates maintained at laboratory conditions. Morphophysiological characterizations were performed, including morphology of colonies, various biochemical tests (growth on different culture media, nitrate reduction, urease, catalase, intrinsic tolerance to antibiotics) and assessing the ability of nitrogen fixation in vitro. As next step, it was assessed the genetic profiles of bacteria by amplification of DNA with primer BOX-PCR, related to repetitive regions and non-coding DNA. It was carried out also the partial sequencing of the 16S rRNA gene of representatives of major bacterial groups obtained with the data on physiology, and identified the genera Pantoea, acillus, Burkholderia and Klebsiella. There was a high variability among the isolates obtained in all parameters, confirming that a population with high morphophysiological and genetic diversity establishes ndophytically with corn. It is interesting that this diversity occurs even in lineages and hybrids obtained in normal improvement to the grass, that do not consider the capacity of association with endophytic bacteria. The establishment of this important collection, with micro-organisms from the genera scarcely studied in association with corn crop in Brazil will allow the conduct of studies to evaluate the capacity or growth romoting biological control of these bacteria.100f. : il.[algumas color.], tabs., grafs.application/pdfDisponível em formato digitalTesesMilhoBactérias nitrificantesGenéticaCaracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALDISSERTACAO_GENETICA_ANGELA_CRISTINA_IKEDA.pdfapplication/pdf4197829https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/22808/1/DISSERTACAO_GENETICA_ANGELA_CRISTINA_IKEDA.pdfec55262b82e1cc8df61ed5b2e36753dcMD51open accessTEXTDISSERTACAO_GENETICA_ANGELA_CRISTINA_IKEDA.pdf.txtExtracted Texttext/plain149054https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/22808/2/DISSERTACAO_GENETICA_ANGELA_CRISTINA_IKEDA.pdf.txte471b89e6573b17c1e6a96dc650718e0MD52open accessTHUMBNAILDISSERTACAO_GENETICA_ANGELA_CRISTINA_IKEDA.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1157https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/22808/3/DISSERTACAO_GENETICA_ANGELA_CRISTINA_IKEDA.pdf.jpga0ba6863dee2705505ad64621a505c1cMD53open access1884/228082022-11-25 15:21:00.128open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/22808Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082022-11-25T18:21Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Caracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)
title Caracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)
spellingShingle Caracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)
Ikeda, Angela Cristina
Teses
Milho
Bactérias nitrificantes
Genética
title_short Caracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)
title_full Caracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)
title_fullStr Caracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)
title_full_unstemmed Caracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)
title_sort Caracterização morfofisiológica e genética de bactérias endofíticas isoladas de raízes de diferentes genótipos de milho (Zea mays L.)
author Ikeda, Angela Cristina
author_facet Ikeda, Angela Cristina
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Hungria, Mariangela, 1958-
Steffens, Maria Berenice Reynaud, 1963-2021
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Galli-Terasawa, Lygia Vitória
dc.contributor.author.fl_str_mv Ikeda, Angela Cristina
contributor_str_mv Galli-Terasawa, Lygia Vitória
dc.subject.por.fl_str_mv Teses
Milho
Bactérias nitrificantes
Genética
topic Teses
Milho
Bactérias nitrificantes
Genética
description Orientadora : Lygia Vitória Galli Terasawa
publishDate 2010
dc.date.issued.fl_str_mv 2010
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-11-25T18:21:00Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-11-25T18:21:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/22808
url https://hdl.handle.net/1884/22808
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.pt_BR.fl_str_mv Disponível em formato digital
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 100f. : il.[algumas color.], tabs., grafs.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/22808/1/DISSERTACAO_GENETICA_ANGELA_CRISTINA_IKEDA.pdf
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/22808/2/DISSERTACAO_GENETICA_ANGELA_CRISTINA_IKEDA.pdf.txt
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/22808/3/DISSERTACAO_GENETICA_ANGELA_CRISTINA_IKEDA.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv ec55262b82e1cc8df61ed5b2e36753dc
e471b89e6573b17c1e6a96dc650718e0
a0ba6863dee2705505ad64621a505c1c
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1813898901700214784