Screening de variantes genéticas do CFTR na fibrose cística por tecnologia de sequenciamento de alto rendimento
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Data de Publicação: | 2023 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRN |
Texto Completo: | https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/54335 |
Resumo: | A fibrose cística (OMIM #219700) é uma doença genética grave, multiorgânica, que afeta células produtoras de muco e suor provocando principalmente infecções pulmonares crônicas, insuficiência pancreática e altos níveis de cloreto no suor. É causada por variantes patogênicas no gene que codifica a proteína reguladora da condutância da fibrose cística (CFTR), sendo mais frequente em pessoas de pele branca. A identificação das variantes causadoras da fibrose cística permite a instituição de uma medicina de precisão a partir das novas terapias moduladoras da proteína CFTR. O presente estudo teve por objetivo descrever os perfis clínico e molecular de pacientes com fibrose cística de um centro de referência do Rio Grande do Norte. A coleta de saliva com swab foi realizada em 37 pacientes com fibrose cística, o DNA foi extraído, e cerca de 50 ng de DNA foram enriquecidos com o Kit Nextera Custom Rapid Capture (Illumina) e o sequenciamento de alto rendimento (HTS - do inglês, High Throughput Sequencing) foi realizado em uma plataforma HiSeq 4000 (Illumina). Foram obtido os genótipos em 31 de 37 (83,8%) pacientes com FC. Foram encontradas onze variantes patogênicas diferentes, sendo a c.1521_1523delCTT a predominante em 27 pacientes (73%) com fibrose cística (54,1% em homozigose e 18,9% em heterozigose composta). Entre os pacientes com pelo menos um alelo com c.1521_1523delCTT, 25 podem ser beneficiados com as terapias moduladoras à base de corretores e potencializadores da proteína CFTR: 5 pacientes de 2 a 5 anos podem ser tratados com a combinação dupla lumacaftor e ivacaftor e 20 pacientes acima de 6 anos podem ser tratados com a combinação tripla elexacaftor, tezacaftor e ivacaftor. Portanto, o tratamento personalizado refletirá no prognóstico e qualidade de vida. |
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É causada por variantes patogênicas no gene que codifica a proteína reguladora da condutância da fibrose cística (CFTR), sendo mais frequente em pessoas de pele branca. A identificação das variantes causadoras da fibrose cística permite a instituição de uma medicina de precisão a partir das novas terapias moduladoras da proteína CFTR. O presente estudo teve por objetivo descrever os perfis clínico e molecular de pacientes com fibrose cística de um centro de referência do Rio Grande do Norte. A coleta de saliva com swab foi realizada em 37 pacientes com fibrose cística, o DNA foi extraído, e cerca de 50 ng de DNA foram enriquecidos com o Kit Nextera Custom Rapid Capture (Illumina) e o sequenciamento de alto rendimento (HTS - do inglês, High Throughput Sequencing) foi realizado em uma plataforma HiSeq 4000 (Illumina). Foram obtido os genótipos em 31 de 37 (83,8%) pacientes com FC. Foram encontradas onze variantes patogênicas diferentes, sendo a c.1521_1523delCTT a predominante em 27 pacientes (73%) com fibrose cística (54,1% em homozigose e 18,9% em heterozigose composta). Entre os pacientes com pelo menos um alelo com c.1521_1523delCTT, 25 podem ser beneficiados com as terapias moduladoras à base de corretores e potencializadores da proteína CFTR: 5 pacientes de 2 a 5 anos podem ser tratados com a combinação dupla lumacaftor e ivacaftor e 20 pacientes acima de 6 anos podem ser tratados com a combinação tripla elexacaftor, tezacaftor e ivacaftor. Portanto, o tratamento personalizado refletirá no prognóstico e qualidade de vida.Cystic fibrosis (OMIM #219700) is a severe, multiorgan genetic disease that affects mucus and sweat-producing cells, primarily causing chronic lung infections, pancreatic insufficiency, and high levels of sweat chloride. It originates from variants in the gene that encodes the cystic fibrosis conductance regulatory protein (CFTR), being more frequent in white people. The identification of the CF pathogenic variants allows the establishment of precision medicine based on new therapies that modulate the CFTR protein. The present study aimed to describe the clinical and molecular profiles of 37 cystic fibrosis patients from a referral center in Rio Grande do Norte. Saliva samples were collected from 37 patients with cystic fibrosis, DNA was extracted, about 50 ng of DNA was enriched with the Nextera Custom Rapid Capture Kit (Illumina, San Diego, CA, USA), and the high throughput sequencing (HTS) was performed through a HiSeq 4000 (Illumina). Eleven different pathogenic variants were found, with c.1521_1523delCTT being the predominant one in 27 cystic fibrosis patients (73%) (54.1% homozygous and 18.9% compound heterozygous). Among the patients with at least one allele with c.1521_1523delCTT, 25 can benefit from CFTR modulators therapies based on correctors and potentiators of the CFTR protein: 5 patients aged 2 to 5 years can be treated with the double combination lumacaftor and ivacaftor and 20 patients aged 6 years old and over can be treated with the triple combination elexacaftor, tezacaftor and ivacaftor. Therefore, personalized treatment will reflect on better control of comorbidities associated with cystic fibrosis, as well as on the prognosis of patients who may have quality of life and increased life expectancy.Universidade Federal do Rio Grande do NortePROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS DA SAÚDEUFRNBrasilCNPQ::CIENCIAS DA SAUDEFibrose císticaManifestações clínicasVariantes patogênicasCFTRMedicina de precisãoTerapias moduladoras da CFTRScreening de variantes genéticas do CFTR na fibrose cística por tecnologia de sequenciamento de alto rendimentoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRNORIGINALScreeningvariantesgeneticas_Melo_2023.pdfapplication/pdf1159883https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/54335/1/Screeningvariantesgeneticas_Melo_2023.pdfa44ddbe7a5ebc0619452fe69c363f0baMD51123456789/543352023-08-02 14:47:47.649oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/54335Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/opendoar:2023-08-02T17:47:47Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false |
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