Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo misto

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Fernandes, Cássio Ramos
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSC
Texto Completo: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/232864
Resumo: TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências da Saúde. Farmácia.
id UFSC_e78d932f7dce8a3235eb8f19f9beea9b
oai_identifier_str oai:repositorio.ufsc.br:123456789/232864
network_acronym_str UFSC
network_name_str Repositório Institucional da UFSC
repository_id_str 2373
spelling Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo mistoscRNA-seqtranscriptomabiologia computacionalTCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências da Saúde. Farmácia.A Leucemia Aguda de Fenótipo Misto representa uma classe de leucemias altamente heterogêneas e de difícil tratamento. Portanto, uma melhor compreensão dos programas de expressão gênicos alterados em células leucêmicas com relação aos tipos celulares correspondentes na medula óssea saudável pode levar a uma melhor compreensão da patofisiologia da doença. Neste trabalho, foram reanalizados dados publicamente disponíveis da medula óssea e amostras provenientes de amostras leucêmicas com o intuito de determinar a similaridade molecular ou diferenças transcricionais entre as células leucêmicas e saudáveis. Utilizando o software FUSCA e o algoritmos Harmony e Symphony, foi elaborado um atlas de referência que representa a diversidade celular da medula óssea saudável. Então, as células leucêmicas foram mapeadas para este atlas de referência utilizando o algoritmo Symphony, ou classificadas utilizando o algoritmo singleCellNet, levando a conclusão que a uma fração substancial das células leucêmicas são transcricionalmente similares às células-tronco e progenitoras sanguíneas, consistente com a possibilidade de diferenciação multilinhagem das células leucêmicas e explicando, ao menos parcialmente, o fenótipo mielóide/linfóide misto desta classe de leucemias.Mixed-phenotype acute leukemia represents a class of highly heterogeneous and difficult to treat leukemias. Therefore, a better understanding of altered gene expression programs in leukemic cells relative to the corresponding cell types in healthy bone marrow may lead to a better understanding of the pathophysiology of the disease. In this work, publicly available data from bone marrow and samples from leukemic samples were reanalyzed in order to determine molecular similarity or transcriptional differences between leukemic and healthy cells. Using the FUSCA and Symphony algorithms, a reference atlas was created that represents the cellular diversity of healthy bone marrow. Then, the leukemic cells were mapped to this reference atlas using the Symphony algorithm, or classified using the singleCellNet algorithm, leading to the conclusion that a substantial fraction of the leukemic cells are transcriptionally similar to blood stem and progenitor cells, consistent with the possibility of multilineage differentiation of leukemic cells and explaining, at least partially, the myeloid/mixed lymphoid phenotype of this class of leukemias.Florianópolis, SCda Rocha, Edroaldo LummertzUniversidade Federal de Santa CatarinaFernandes, Cássio Ramos2022-03-24T20:19:57Z2022-03-24T20:19:57Z2022-03-15info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis33application/pdfhttps://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/232864info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFSCinstname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)instacron:UFSC2022-03-24T20:19:57Zoai:repositorio.ufsc.br:123456789/232864Repositório InstitucionalPUBhttp://150.162.242.35/oai/requestopendoar:23732022-03-24T20:19:57Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo misto
title Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo misto
spellingShingle Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo misto
Fernandes, Cássio Ramos
scRNA-seq
transcriptoma
biologia computacional
title_short Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo misto
title_full Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo misto
title_fullStr Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo misto
title_full_unstemmed Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo misto
title_sort Análise de dados de transcriptoma de pacientes com leucemia aguda de fenótipo misto
author Fernandes, Cássio Ramos
author_facet Fernandes, Cássio Ramos
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv da Rocha, Edroaldo Lummertz
Universidade Federal de Santa Catarina
dc.contributor.author.fl_str_mv Fernandes, Cássio Ramos
dc.subject.por.fl_str_mv scRNA-seq
transcriptoma
biologia computacional
topic scRNA-seq
transcriptoma
biologia computacional
description TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências da Saúde. Farmácia.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-03-24T20:19:57Z
2022-03-24T20:19:57Z
2022-03-15
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/232864
url https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/232864
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 33
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Florianópolis, SC
publisher.none.fl_str_mv Florianópolis, SC
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSC
instname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron:UFSC
instname_str Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron_str UFSC
institution UFSC
reponame_str Repositório Institucional da UFSC
collection Repositório Institucional da UFSC
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808652386177122304

Registros relacionados