Análise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores moleculares

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Abadio, Ana Karina Rodrigues
Data de Publicação: 2007
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: http://locus.ufv.br/handle/123456789/5391
Resumo: The angular leaf spot, caused by Phaeoisariopsis griseola, also known as Pseudocercospora griseola (Sacc.) Crous & U. Braun, is one of the most important diseases in the bean plant, causing serious damages to the production. The most efficient cost strategy for the management of plant diseases is the use of resistant cultivars. However, studies related to the genetic diversity of P. griseola have been demonstrating great genetic variability in this fungus, what has been hardening the achievement of those cultivars. Therefore, the aim of this work was to verify if the techniques of ERIC-PCR, BOX-PCR, ISSR-PCR and PCR- RFLP of the rDNA ITS region are able to detect the genetic diversity of the P. griseola isolates from Goiás, Minas Gerais, Espírito Santo and Paraná states. The total DNA of the 29 P. griseola isolates were extracted and, later, amplified using specific primers for ERIC, BOX, ISRR and ITS sequences. The cleavages of the ITS region with the restriction enzymes AluI, HaeIII, HhaI, HpaII, MboI, MspI e RsaI produced identical restriction profiles for all the isolates, and, therefore, the ITS sequence under used conditions supply markers that could differ the isolates of P. griseola. Through the grouping analysis of the results obtained by the BOX-PCR, ERIC-PCR and ISSR-PCR techniques, 2, 5, and 28 genotypes were revealed, respectively, among the isolates studied. Those results showed that BOX-PCR and ERIC-PCR techniques were less efficient to detect the genetic variability of P. griseola isolates. The best results were obtained using the ISSR- PCR technique, revealing high capacity in the polymorphism detection among the isolates. The genetic diversity observed can help in the development of appropriate strategies to obtain resistant bean plant varieties to this fungus.
id UFV_5e79e053f55297211b0cf3bb3b223f1e
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/5391
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str 2145
spelling Abadio, Ana Karina Rodrigueshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4704734Y2Araujo, Elza Fernandes dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783675E2Salomão, Tânia Maria Fernandeshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787017A5Queiroz, Marisa Vieira dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785812Z5Bazzolli, Denise Mara Soareshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761710D6Pereira, Olinto Liparinihttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4767879D42015-03-26T13:52:03Z2007-11-092015-03-26T13:52:03Z2007-08-15ABADIO, Ana Karina Rodrigues. Genetic diversity of Phaeoisariopsis griseola isolates revealed by molecular markers. 2007. 51 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2007.http://locus.ufv.br/handle/123456789/5391The angular leaf spot, caused by Phaeoisariopsis griseola, also known as Pseudocercospora griseola (Sacc.) Crous & U. Braun, is one of the most important diseases in the bean plant, causing serious damages to the production. The most efficient cost strategy for the management of plant diseases is the use of resistant cultivars. However, studies related to the genetic diversity of P. griseola have been demonstrating great genetic variability in this fungus, what has been hardening the achievement of those cultivars. Therefore, the aim of this work was to verify if the techniques of ERIC-PCR, BOX-PCR, ISSR-PCR and PCR- RFLP of the rDNA ITS region are able to detect the genetic diversity of the P. griseola isolates from Goiás, Minas Gerais, Espírito Santo and Paraná states. The total DNA of the 29 P. griseola isolates were extracted and, later, amplified using specific primers for ERIC, BOX, ISRR and ITS sequences. The cleavages of the ITS region with the restriction enzymes AluI, HaeIII, HhaI, HpaII, MboI, MspI e RsaI produced identical restriction profiles for all the isolates, and, therefore, the ITS sequence under used conditions supply markers that could differ the isolates of P. griseola. Through the grouping analysis of the results obtained by the BOX-PCR, ERIC-PCR and ISSR-PCR techniques, 2, 5, and 28 genotypes were revealed, respectively, among the isolates studied. Those results showed that BOX-PCR and ERIC-PCR techniques were less efficient to detect the genetic variability of P. griseola isolates. The best results were obtained using the ISSR- PCR technique, revealing high capacity in the polymorphism detection among the isolates. The genetic diversity observed can help in the development of appropriate strategies to obtain resistant bean plant varieties to this fungus.A mancha-angular, causada pelo fungo Phaeoisariopsis griseola, também conhecido como Pseudocercospora griseola (Sacc.) Crous & U. Braun, é uma das doenças mais importantes que ocorre no feijoeiro, causando sérios prejuízos na produção. A forma mais econômica de controle dessa doença é a utilização de cultivares resistentes. Entretanto, estudos relacionados à diversidade genética de P. griseola têm demonstrado grande variabilidade genética nesse fungo, o que tem dificultado a obtenção dessas cultivares. Diante disso, o objetivo desse trabalho foi verificar se as técnicas ERIC-PCR, BOX-PCR, ISSR-PCR e PCR-RFLP da região ITS do rDNA são apropriadas para a detecção de polimorfismos genéticos que permitam estimar a diversidade genética de isolados de P. griseola provenientes dos estados de Goiás, Minas Gerais, Espírito Santo e Paraná. O DNA total de 29 isolados de P. griseola foi extraído e, posteriormente, utilizado para amplificação de seqüências ERIC, BOX, ISSR e ITS utilizando oligonucleotídeos específicos. As clivagens da região ITS com as enzimas de restrição AluI, HaeIII, HhaI, HpaII, MboI, MspI e RsaI produziram perfis de restrição idênticos para todos os isolados, e, portanto, a sequência ITS nas condições empregadas não forneceu marcadores que pudessem diferenciar os isolados de P. griseola. Por meio da análise de agrupamento dos resultados obtidos pelas técnicas BOX-PCR, ERIC-PCR e ISSR-PCR, foram detectados 2, 5 e 28 genótipos, respectivamente, entre os isolados estudados. Os resultados obtidos mostraram que as técnicas BOX-PCR e ERIC-PCR foram menos eficientes na detecção de polimorfismo genético entre os isolados de P. griseola. Os melhores resultados foram obtidos com o emprego da técnica ISSR- PCR, que mostrou grande capacidade de detecção de marcadores polimórficos entre os isolados. A diversidade genética estimada poderá auxiliar no desenvolvimento de estratégias adequadas para a obtenção de variedades de feijoeiro resistentes a esse fungo.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaMestrado em Microbiologia AgrícolaUFVBRAssociações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interessePseudocercospora griseolaERICBOXISSRITSPseudocercospora griseolaERIC, BOX, ISRRITSCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADE::MICROBIOLOGIA AGRICOLAAnálise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores molecularesGenetic diversity of Phaeoisariopsis griseola isolates revealed by molecular markersinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf868663https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/5391/1/texto%20completo.pdf23683551a9b1133991133585463f9959MD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain70543https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/5391/2/texto%20completo.pdf.txt1bd61b84e916d37bfd3e27b63c405088MD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3694https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/5391/3/texto%20completo.pdf.jpg6514b7958b04d7542ea86a603c7e3dabMD53123456789/53912016-04-10 23:20:16.208oai:locus.ufv.br:123456789/5391Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-11T02:20:16LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.por.fl_str_mv Análise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores moleculares
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Genetic diversity of Phaeoisariopsis griseola isolates revealed by molecular markers
title Análise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores moleculares
spellingShingle Análise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores moleculares
Abadio, Ana Karina Rodrigues
Pseudocercospora griseola
ERIC
BOX
ISSR
ITS
Pseudocercospora griseola
ERIC, BOX, ISRR
ITS
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADE::MICROBIOLOGIA AGRICOLA
title_short Análise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores moleculares
title_full Análise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores moleculares
title_fullStr Análise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores moleculares
title_full_unstemmed Análise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores moleculares
title_sort Análise da diversidade genética de isolados de Phaeoisariopsis griseola por meio de marcadores moleculares
author Abadio, Ana Karina Rodrigues
author_facet Abadio, Ana Karina Rodrigues
author_role author
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4704734Y2
dc.contributor.author.fl_str_mv Abadio, Ana Karina Rodrigues
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Araujo, Elza Fernandes de
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783675E2
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv Salomão, Tânia Maria Fernandes
dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787017A5
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Queiroz, Marisa Vieira de
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785812Z5
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Bazzolli, Denise Mara Soares
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761710D6
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Pereira, Olinto Liparini
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4767879D4
contributor_str_mv Araujo, Elza Fernandes de
Salomão, Tânia Maria Fernandes
Queiroz, Marisa Vieira de
Bazzolli, Denise Mara Soares
Pereira, Olinto Liparini
dc.subject.por.fl_str_mv Pseudocercospora griseola
ERIC
BOX
ISSR
ITS
topic Pseudocercospora griseola
ERIC
BOX
ISSR
ITS
Pseudocercospora griseola
ERIC, BOX, ISRR
ITS
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADE::MICROBIOLOGIA AGRICOLA
dc.subject.eng.fl_str_mv Pseudocercospora griseola
ERIC, BOX, ISRR
ITS
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADE::MICROBIOLOGIA AGRICOLA
description The angular leaf spot, caused by Phaeoisariopsis griseola, also known as Pseudocercospora griseola (Sacc.) Crous & U. Braun, is one of the most important diseases in the bean plant, causing serious damages to the production. The most efficient cost strategy for the management of plant diseases is the use of resistant cultivars. However, studies related to the genetic diversity of P. griseola have been demonstrating great genetic variability in this fungus, what has been hardening the achievement of those cultivars. Therefore, the aim of this work was to verify if the techniques of ERIC-PCR, BOX-PCR, ISSR-PCR and PCR- RFLP of the rDNA ITS region are able to detect the genetic diversity of the P. griseola isolates from Goiás, Minas Gerais, Espírito Santo and Paraná states. The total DNA of the 29 P. griseola isolates were extracted and, later, amplified using specific primers for ERIC, BOX, ISRR and ITS sequences. The cleavages of the ITS region with the restriction enzymes AluI, HaeIII, HhaI, HpaII, MboI, MspI e RsaI produced identical restriction profiles for all the isolates, and, therefore, the ITS sequence under used conditions supply markers that could differ the isolates of P. griseola. Through the grouping analysis of the results obtained by the BOX-PCR, ERIC-PCR and ISSR-PCR techniques, 2, 5, and 28 genotypes were revealed, respectively, among the isolates studied. Those results showed that BOX-PCR and ERIC-PCR techniques were less efficient to detect the genetic variability of P. griseola isolates. The best results were obtained using the ISSR- PCR technique, revealing high capacity in the polymorphism detection among the isolates. The genetic diversity observed can help in the development of appropriate strategies to obtain resistant bean plant varieties to this fungus.
publishDate 2007
dc.date.available.fl_str_mv 2007-11-09
2015-03-26T13:52:03Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2007-08-15
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-26T13:52:03Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv ABADIO, Ana Karina Rodrigues. Genetic diversity of Phaeoisariopsis griseola isolates revealed by molecular markers. 2007. 51 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2007.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://locus.ufv.br/handle/123456789/5391
identifier_str_mv ABADIO, Ana Karina Rodrigues. Genetic diversity of Phaeoisariopsis griseola isolates revealed by molecular markers. 2007. 51 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2007.
url http://locus.ufv.br/handle/123456789/5391
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.publisher.program.fl_str_mv Mestrado em Microbiologia Agrícola
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFV
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/5391/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/5391/2/texto%20completo.pdf.txt
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/5391/3/texto%20completo.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 23683551a9b1133991133585463f9959
1bd61b84e916d37bfd3e27b63c405088
6514b7958b04d7542ea86a603c7e3dab
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1801213028231806976