Investigação da suscetibilidade genética à periodontite crônica associada ao diabetes mellitus tipo 2
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Data de Publicação: | 2020 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11449/194129 |
Resumo: | Periodontite (P) e Diabetes Mellitus Tipo 2 (DM2) são doenças com grande prevalência na população, e o número de pacientes afetados por ambas as doenças, como comorbidades, tem se tornando cada vez maior. Além disso, a periodontite e a DM2 são doenças complexas que possuem mecanismos patogênicos comuns, mas o potencial componente genético que pode ser compartilhado entre essas doenças permanece pouco investigado. Marcadores genéticos de risco para cada uma dessas doenças foram identificados, mas devem ser avaliados em diferentes populações, para serem validados. Além disso é importante verificar se tais marcadores genéticos isolados seriam úteis na identificação da ocorrência conjunta dessas doenças como comorbidades. O objetivo deste estudo em uma população brasileira foi dividido em 2 capítulos: (i) Avaliar se os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) nos genes IL10, IL1A, IL1B, IL4, TNFA, IL6, OPG, RANK e RANKL, "classicamente" relacionados à periodontite, podem estar associados à suscetibilidade ao DM2 e também com ambas as doenças concomitantemente; (ii) avaliar 12 SNPs selecionados a partir de estudos de associação ampla do genoma (GWAS) e bioinformática previamente associados a DM2 ou à periodontite isoladamente, como marcadores genéticos para DM2, ou periodontite, ou ambas doenças como comorbidades. Considerando o cálculo amostral, 956 pacientes foram submetidos a exame periodontal completo, além da análise bioquímica do seu perfil glicêmico e lipídico. Foram investigados pacientes com DM2 e P (Grupo DM2+P, n=239 pacientes); e para comparação dos resultados foram considerados pacientes sem DM2 com P severa ou moderada (Grupo Periodontite, n=358), e também pacientes sem DM2 e sem P, sendo considerados saudáveis (Grupo Controle, n=356). Assim, o grupo Periodontite foi considerado controle para o DM2 e o Grupo Controle foi considerado controle para a DM2 e a P. Após exame periodontal completo e realização dos exames bioquímicos, foi obtido o bochecho de cada paciente para extração do DNA pelo método Salting-out. Ao todo, 21 polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) foram investigados por meio do sistema de genotipagem OpenArray. As associações entre SNPs e patologias foram testadas por regressões logísticas múltiplas, ajustando-se à idade, sexo e hábito de fumar. Também investigamos se houve efeito influenciado pelo sexo ou tabagismo em cada SNP na ocorrência desses fenótipos. Referente ao capítulo 1 verificou-se que o SNP rs1143634-GA (IL1B) apresentou probabilidade significativamente menor de desenvolver DM2+P em toda a população, mas principalmente em mulheres (OR ajustado = 0,37, IC 95% = 0,16 - 0,88, p = 0,02), enquanto mulheres portadoras do genótipo CT rs224320 (IL4) foram mais suscetíveis a desenvolver DM2+P (OR ajustado = 1,81, IC 95% = 1,04-3,15, p = 0,03). Homens portadores do genótipo rs1800795-CC (IL6) apresentaram menor probabilidade de desenvolver DM2+P (OR ajustado = 0,12, IC 95% = 0,02 - 0,70, p = 0,01). No capítulo 2, considerando a correção de Bonferroni, identificou-se que o genótipo rs7957197-TA (gene HNF1A) foi associado à maior suscetibilidade ao DM2+P (Periodontite versus DM2+P, OR = 1,95; IC 95% = 1,26–3,02; p = 0,003) em toda população e também para os homens comparados às mulheres. Mulheres portadoras do genótipo rs77544840-GT (gene CDKAL1) também mostraram suscetibilidade ao DM2+P (P versus P+DM2, OR = 2,49; IC 95% = 1,41–4,42; p = 0,002). Os pacientes homozigotos para o alelo mais raro (GG) do rs7018475 (gene CDKN2B) mostraram suscetibilidade para desenvolverem DM2+P (todo o controle versus todos os DM2+P, OR = 3,91; IC95% = 1,76–8,70; p = 0,001), bem como para mulheres e nunca fumantes. Portanto, pode-se concluir que SNPs nos genes IL1B, IL4 e IL6 demonstraram associação influenciada pelo sexo com periodontite concomitante ao DM2, aumentando as evidências de um componente genético comum entre essas doenças. As variantes genéticas rs7957197 (HNF1A) e rs77544840 (CDKAL1) foram validadas nos brasileiros como marcadores de risco para DM2+P. O rs7018475 (CDKN2B) foi associado com maior risco para o desenvolvimento de periodontite juntamente com DM2 (DM2+P). Como esses achados eram específicos ao sexo, mais estudos com critérios de seleção semelhantes são necessários para confirmar os resultados observados e investigar o papel funcional desses SNPs no contexto do fenótipo de sexo e doença. |
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Investigação da suscetibilidade genética à periodontite crônica associada ao diabetes mellitus tipo 2Investigation of genetic susceptibility to chronic periodontitis associated with type 2 diabetes mellitusPolimorfismo genéticoPeriodontiteDiabetes mellitusGenetic polymorphismPeriodontitisDiabetes mellitusPeriodontite (P) e Diabetes Mellitus Tipo 2 (DM2) são doenças com grande prevalência na população, e o número de pacientes afetados por ambas as doenças, como comorbidades, tem se tornando cada vez maior. Além disso, a periodontite e a DM2 são doenças complexas que possuem mecanismos patogênicos comuns, mas o potencial componente genético que pode ser compartilhado entre essas doenças permanece pouco investigado. Marcadores genéticos de risco para cada uma dessas doenças foram identificados, mas devem ser avaliados em diferentes populações, para serem validados. Além disso é importante verificar se tais marcadores genéticos isolados seriam úteis na identificação da ocorrência conjunta dessas doenças como comorbidades. O objetivo deste estudo em uma população brasileira foi dividido em 2 capítulos: (i) Avaliar se os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) nos genes IL10, IL1A, IL1B, IL4, TNFA, IL6, OPG, RANK e RANKL, "classicamente" relacionados à periodontite, podem estar associados à suscetibilidade ao DM2 e também com ambas as doenças concomitantemente; (ii) avaliar 12 SNPs selecionados a partir de estudos de associação ampla do genoma (GWAS) e bioinformática previamente associados a DM2 ou à periodontite isoladamente, como marcadores genéticos para DM2, ou periodontite, ou ambas doenças como comorbidades. Considerando o cálculo amostral, 956 pacientes foram submetidos a exame periodontal completo, além da análise bioquímica do seu perfil glicêmico e lipídico. Foram investigados pacientes com DM2 e P (Grupo DM2+P, n=239 pacientes); e para comparação dos resultados foram considerados pacientes sem DM2 com P severa ou moderada (Grupo Periodontite, n=358), e também pacientes sem DM2 e sem P, sendo considerados saudáveis (Grupo Controle, n=356). Assim, o grupo Periodontite foi considerado controle para o DM2 e o Grupo Controle foi considerado controle para a DM2 e a P. Após exame periodontal completo e realização dos exames bioquímicos, foi obtido o bochecho de cada paciente para extração do DNA pelo método Salting-out. Ao todo, 21 polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) foram investigados por meio do sistema de genotipagem OpenArray. As associações entre SNPs e patologias foram testadas por regressões logísticas múltiplas, ajustando-se à idade, sexo e hábito de fumar. Também investigamos se houve efeito influenciado pelo sexo ou tabagismo em cada SNP na ocorrência desses fenótipos. Referente ao capítulo 1 verificou-se que o SNP rs1143634-GA (IL1B) apresentou probabilidade significativamente menor de desenvolver DM2+P em toda a população, mas principalmente em mulheres (OR ajustado = 0,37, IC 95% = 0,16 - 0,88, p = 0,02), enquanto mulheres portadoras do genótipo CT rs224320 (IL4) foram mais suscetíveis a desenvolver DM2+P (OR ajustado = 1,81, IC 95% = 1,04-3,15, p = 0,03). Homens portadores do genótipo rs1800795-CC (IL6) apresentaram menor probabilidade de desenvolver DM2+P (OR ajustado = 0,12, IC 95% = 0,02 - 0,70, p = 0,01). No capítulo 2, considerando a correção de Bonferroni, identificou-se que o genótipo rs7957197-TA (gene HNF1A) foi associado à maior suscetibilidade ao DM2+P (Periodontite versus DM2+P, OR = 1,95; IC 95% = 1,26–3,02; p = 0,003) em toda população e também para os homens comparados às mulheres. Mulheres portadoras do genótipo rs77544840-GT (gene CDKAL1) também mostraram suscetibilidade ao DM2+P (P versus P+DM2, OR = 2,49; IC 95% = 1,41–4,42; p = 0,002). Os pacientes homozigotos para o alelo mais raro (GG) do rs7018475 (gene CDKN2B) mostraram suscetibilidade para desenvolverem DM2+P (todo o controle versus todos os DM2+P, OR = 3,91; IC95% = 1,76–8,70; p = 0,001), bem como para mulheres e nunca fumantes. Portanto, pode-se concluir que SNPs nos genes IL1B, IL4 e IL6 demonstraram associação influenciada pelo sexo com periodontite concomitante ao DM2, aumentando as evidências de um componente genético comum entre essas doenças. As variantes genéticas rs7957197 (HNF1A) e rs77544840 (CDKAL1) foram validadas nos brasileiros como marcadores de risco para DM2+P. O rs7018475 (CDKN2B) foi associado com maior risco para o desenvolvimento de periodontite juntamente com DM2 (DM2+P). Como esses achados eram específicos ao sexo, mais estudos com critérios de seleção semelhantes são necessários para confirmar os resultados observados e investigar o papel funcional desses SNPs no contexto do fenótipo de sexo e doença.Periodontitis (P) and Diabetes Mellitus Type 2 (T2DM) are diseases with a high prevalence in the population, and the number of patients affected by both diseases, such as comorbidities, has been increasing. In addition, periodontitis and T2DM are complex diseases that have common pathogenic mechanisms, but the potential genetic component that can be shared between these diseases remains poorly investigated. Genetic risk markers for each of these diseases have been identified, but they must be evaluated in different populations to be validated. In addition, it is important to verify whether such isolated genetic markers would be useful in identifying the joint occurrence of these diseases as comorbidities. The objective of this study in a Brazilian population was divided into 2 publications: (i) To assess whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the IL10, IL1A, IL1B, IL4, TNFA, IL6, OPG, RANK and RANKL genes, "classically" related to periodontitis, may be associated with susceptibility to T2DM and also with both diseases concomitantly; (ii) evaluate 12 SNPs selected from studies of genome-wide association (GWAS) and bioinformatics previously associated with T2DM or periodontitis alone, as genetic markers for T2DM, or periodontitis, or both diseases as comorbidities. Considering the sample size, 956 patients underwent a complete periodontal examination, in addition to biochemical analysis of their glycemic and lipid profile. Patients with T2DM and P (Group T2DM+P, n=239 patients) were investigated; and for comparison of results, patients without T2DM with severe or moderate P (Periodontitis Group, n = 358) were considered, and also patients without T2DM and without P, being considered healthy (Control Group, n = 356). Thus, the Periodontitis group was considered control for T2DM and the Control Group was considered control for T2DM and P. After a complete periodontal examination and biochemical tests, each patient's mouthwash was obtained for DNA extraction using the Salting- out. The 21 single nucleotide polymorphisms (SNP) were investigated using the OpenArray genotyping system. The associations between SNPs and pathologies were tested by multiple logistic regressions, adjusting for age, sex and smoking. We also investigated whether there was an effect influenced by sex or smoking in each SNP on the occurrence of these phenotypes. Regarding publication 1, it was found that the SNP rs1143634-GA (IL1B) was significantly less likely to develop P+T2DM in the entire population, but mainly in women (adjusted OR = 0.37, 95% CI = 0.16 - 0.88, p = 0.02), while women with the CT rs224320 (IL4) genotype were more susceptible to developing P+T2DM (adjusted OR = 1.81, 95% CI = 1.04-3.15, p = 0.03). Men with the rs1800795-CC (IL6) genotype were less likely to develop T2DM (adjusted OR = 0.12, 95% CI = 0.02 - 0.70, p = 0.01). In publication 2, considering Bonferroni’s correction, it was found that the rs7957197-TA genotype (HNF1A gene) was associated with greater susceptibility to T2DM (Periodontitis versus P+T2DM, OR=1.95; 95% CI=1.26 –3.02; p=0.003) in the entire population and also for men compared to women. Women with the rs77544840-GT genotype (CDKAL1 gene) also showed susceptibility to T2DM (P versus P+T2DM, OR = 2.49; 95% CI = 1.41–4.42; p = 0.002). The patients homozygous for the rarer (GG) allele of rs7018475 (CDKN2B gene) showed susceptibility to develop P+T2DM (all control versus all P + T2DM, OR=3.91; 95% CI=1.76–8, 70; p=0.001), as well as for women and never smokers. Therefore, it can be concluded that SNPs in the IL1B, IL4 and IL6 genes demonstrated an association influenced by sex with periodontitis concomitant with T2DM, increasing the evidence of a common genetic component between these diseases. The genetic variants rs7957197 (HNF1A) and rs77544840 (CDKAL1) have been validated in Brazil as risk markers for T2DM. Rs7018475 (CDKN2B) was associated with an increased risk of developing periodontitis along with T2DM (P + T2DM). As these findings were sex-specific, further studies with similar selection criteria are needed to confirm the observed results and to investigate the functional role of these SNPs in the context of the sex and disease phenotype.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Processo FAPESP nº2016/08070-6Processo FAPESP nº2014/13295-1Processo FAPESP n°2016/03753-8Processo FAPESP n°2016/18313-3Processo FAPESP n°2018/26367-1Universidade Estadual Paulista (Unesp)Scarel-Caminaga, Raquel Mantuaneli [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Cirelli, Thamiris2020-10-20T16:11:26Z2020-10-20T16:11:26Z2020-09-24info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/19412933004030059P1porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2024-09-30T14:55:19Zoai:repositorio.unesp.br:11449/194129Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462024-09-30T14:55:19Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
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Periodontite (P) e Diabetes Mellitus Tipo 2 (DM2) são doenças com grande prevalência na população, e o número de pacientes afetados por ambas as doenças, como comorbidades, tem se tornando cada vez maior. Além disso, a periodontite e a DM2 são doenças complexas que possuem mecanismos patogênicos comuns, mas o potencial componente genético que pode ser compartilhado entre essas doenças permanece pouco investigado. Marcadores genéticos de risco para cada uma dessas doenças foram identificados, mas devem ser avaliados em diferentes populações, para serem validados. Além disso é importante verificar se tais marcadores genéticos isolados seriam úteis na identificação da ocorrência conjunta dessas doenças como comorbidades. O objetivo deste estudo em uma população brasileira foi dividido em 2 capítulos: (i) Avaliar se os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) nos genes IL10, IL1A, IL1B, IL4, TNFA, IL6, OPG, RANK e RANKL, "classicamente" relacionados à periodontite, podem estar associados à suscetibilidade ao DM2 e também com ambas as doenças concomitantemente; (ii) avaliar 12 SNPs selecionados a partir de estudos de associação ampla do genoma (GWAS) e bioinformática previamente associados a DM2 ou à periodontite isoladamente, como marcadores genéticos para DM2, ou periodontite, ou ambas doenças como comorbidades. Considerando o cálculo amostral, 956 pacientes foram submetidos a exame periodontal completo, além da análise bioquímica do seu perfil glicêmico e lipídico. Foram investigados pacientes com DM2 e P (Grupo DM2+P, n=239 pacientes); e para comparação dos resultados foram considerados pacientes sem DM2 com P severa ou moderada (Grupo Periodontite, n=358), e também pacientes sem DM2 e sem P, sendo considerados saudáveis (Grupo Controle, n=356). Assim, o grupo Periodontite foi considerado controle para o DM2 e o Grupo Controle foi considerado controle para a DM2 e a P. Após exame periodontal completo e realização dos exames bioquímicos, foi obtido o bochecho de cada paciente para extração do DNA pelo método Salting-out. Ao todo, 21 polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) foram investigados por meio do sistema de genotipagem OpenArray. As associações entre SNPs e patologias foram testadas por regressões logísticas múltiplas, ajustando-se à idade, sexo e hábito de fumar. Também investigamos se houve efeito influenciado pelo sexo ou tabagismo em cada SNP na ocorrência desses fenótipos. Referente ao capítulo 1 verificou-se que o SNP rs1143634-GA (IL1B) apresentou probabilidade significativamente menor de desenvolver DM2+P em toda a população, mas principalmente em mulheres (OR ajustado = 0,37, IC 95% = 0,16 - 0,88, p = 0,02), enquanto mulheres portadoras do genótipo CT rs224320 (IL4) foram mais suscetíveis a desenvolver DM2+P (OR ajustado = 1,81, IC 95% = 1,04-3,15, p = 0,03). Homens portadores do genótipo rs1800795-CC (IL6) apresentaram menor probabilidade de desenvolver DM2+P (OR ajustado = 0,12, IC 95% = 0,02 - 0,70, p = 0,01). No capítulo 2, considerando a correção de Bonferroni, identificou-se que o genótipo rs7957197-TA (gene HNF1A) foi associado à maior suscetibilidade ao DM2+P (Periodontite versus DM2+P, OR = 1,95; IC 95% = 1,26–3,02; p = 0,003) em toda população e também para os homens comparados às mulheres. Mulheres portadoras do genótipo rs77544840-GT (gene CDKAL1) também mostraram suscetibilidade ao DM2+P (P versus P+DM2, OR = 2,49; IC 95% = 1,41–4,42; p = 0,002). Os pacientes homozigotos para o alelo mais raro (GG) do rs7018475 (gene CDKN2B) mostraram suscetibilidade para desenvolverem DM2+P (todo o controle versus todos os DM2+P, OR = 3,91; IC95% = 1,76–8,70; p = 0,001), bem como para mulheres e nunca fumantes. Portanto, pode-se concluir que SNPs nos genes IL1B, IL4 e IL6 demonstraram associação influenciada pelo sexo com periodontite concomitante ao DM2, aumentando as evidências de um componente genético comum entre essas doenças. As variantes genéticas rs7957197 (HNF1A) e rs77544840 (CDKAL1) foram validadas nos brasileiros como marcadores de risco para DM2+P. O rs7018475 (CDKN2B) foi associado com maior risco para o desenvolvimento de periodontite juntamente com DM2 (DM2+P). Como esses achados eram específicos ao sexo, mais estudos com critérios de seleção semelhantes são necessários para confirmar os resultados observados e investigar o papel funcional desses SNPs no contexto do fenótipo de sexo e doença. |
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