Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Vieira, Luiz Carlos
Data de Publicação: 1999
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13082001-143828/
Resumo: Vírus causadores de gastroenterite, descritos como pequenos vírus de estrutura arredondada (Small Round Structured Viruses-SRSV), foram detectados em extratos de ostras Crassostrea spp., coletadas em regiões distintas do litoral do Estado de São Paulo, utilizando a Reação em Cadeia por Polimerase com transcrição reversa (RT-PCR).Treze lotes de amostras, contendo 10 g de estômagos e divertículos, foram processados para extração e concentração das partículas virais, mediante adsorção-eluição e precipitação por polietilenoglicol (PEG 6000), e purificação com fluorocarbono (Freon, Dupont Co.) para eliminação prévia dos inibidores da reação de RT-PCR. A extração do ácido nucleico viral, foi realizada com uma mistura de isotiocianato de guanidina e fenol (TRIzol ®, Gibco) e clorofórmio, sendo completada com uma purificação em coluna spin, com membrana de polissulfona (Millipore,Corp.). A reação de RT-PCR foi realizada em uma única etapa, utilizando o kit \'\'Super Script ONE-STEP RT-PCR System\'\'® (Gibco). A reação de amplificação enzimática revelou, por eletroforese em gel de agarose (2%), corada com brometo de etídio, produtos de 123 bp, em 3 (23%) dos 13 lotes de amostras coletadas durante o verão de 1998, sendo verificadas em uma delas por imunomicroscopia eletrônica (IME),partículas de SRSV. Os produtos encontrados pertencem ao grupo genômico G2(Snow Mountain e outros vírus). A aplicação deste método possibilitou pela 1ª vez a detecção molecular de SRSVs no Brasil em ostras naturalmente contaminadas.
id USP_775f584fad9a4ef0f4187d59365064a6
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-13082001-143828
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.Detection of human calicivirus (Small round structured virus - SRSV) using polymerase chain reaction (PCR) in oysters from São Paulo beaches, Brazil.caliciviridaecalicivírus humanohuman calicivirusnorwalk virusostrasoysterspolymerase chain reactionreação em cadeia por polimerasesão paulo spvírus norwalkVírus causadores de gastroenterite, descritos como pequenos vírus de estrutura arredondada (Small Round Structured Viruses-SRSV), foram detectados em extratos de ostras Crassostrea spp., coletadas em regiões distintas do litoral do Estado de São Paulo, utilizando a Reação em Cadeia por Polimerase com transcrição reversa (RT-PCR).Treze lotes de amostras, contendo 10 g de estômagos e divertículos, foram processados para extração e concentração das partículas virais, mediante adsorção-eluição e precipitação por polietilenoglicol (PEG 6000), e purificação com fluorocarbono (Freon, Dupont Co.) para eliminação prévia dos inibidores da reação de RT-PCR. A extração do ácido nucleico viral, foi realizada com uma mistura de isotiocianato de guanidina e fenol (TRIzol ®, Gibco) e clorofórmio, sendo completada com uma purificação em coluna spin, com membrana de polissulfona (Millipore,Corp.). A reação de RT-PCR foi realizada em uma única etapa, utilizando o kit \'\'Super Script ONE-STEP RT-PCR System\'\'® (Gibco). A reação de amplificação enzimática revelou, por eletroforese em gel de agarose (2%), corada com brometo de etídio, produtos de 123 bp, em 3 (23%) dos 13 lotes de amostras coletadas durante o verão de 1998, sendo verificadas em uma delas por imunomicroscopia eletrônica (IME),partículas de SRSV. Os produtos encontrados pertencem ao grupo genômico G2(Snow Mountain e outros vírus). A aplicação deste método possibilitou pela 1ª vez a detecção molecular de SRSVs no Brasil em ostras naturalmente contaminadas.The Small Round Structured Viruses (SRSVs) have been associated with gastroenteritis in humans, and were detected in extracts of oysters Crassostrea spp., by Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT - PCR). Thirteen lots of samples, originated from different regions of the State of São Paulo, were processed for viral particles extraction. The samples, containing 10 g of stomach and diverticula, were extracted by adsorption - elution and polyethylene glycol (PEG 6000) precipitation, and fluorocarbon (Freon, Dupont Co.) was used for purification and previous elimination of RT - PCR inhibitors. For the viral nucleic acid extraction, guanidine isothiocyanate - phenol mixture (TrizolÒ, Gibco ) and chloroform were used, followed by a polysulfone spin column (Millipore, Corp.) purification. The RT-PCR was done in one step, using the \'\'Super Script ONE-STEP RT-PCR System\'\'® (Gibco). The enzimatic amplification reaction run in 2% agarose gel electrophoresis stained with ethidium bromide, revealed 123 bp products in 3 (23%) of the 13 lots of samples collected during the summer of 1998. One of these three samples was positive for SRSV particles by Immune Electron Microscopy (IEM). These 3 products were classified in the Genogroup G2 (Snow Mountain and others viruses). The application of this methodology made it possible to detected, in a molecular basis, the first cases of SRSVs in environmentally contaminated oysters in Brazil.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPStewien, Klaus EberhardVieira, Luiz Carlos1999-06-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13082001-143828/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2018-11-28T16:04:31Zoai:teses.usp.br:tde-13082001-143828Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212018-11-28T16:04:31Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.
Detection of human calicivirus (Small round structured virus - SRSV) using polymerase chain reaction (PCR) in oysters from São Paulo beaches, Brazil.
title Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.
spellingShingle Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.
Vieira, Luiz Carlos
caliciviridae
calicivírus humano
human calicivirus
norwalk virus
ostras
oysters
polymerase chain reaction
reação em cadeia por polimerase
são paulo sp
vírus norwalk
title_short Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.
title_full Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.
title_fullStr Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.
title_full_unstemmed Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.
title_sort Detecção de Calicivírus Humano (Small Round Structured Virus-SRSV) pela Reação em Cadeia da Polimerase( PCR) em Ostras do Litoral do Estado de São Paulo.
author Vieira, Luiz Carlos
author_facet Vieira, Luiz Carlos
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Stewien, Klaus Eberhard
dc.contributor.author.fl_str_mv Vieira, Luiz Carlos
dc.subject.por.fl_str_mv caliciviridae
calicivírus humano
human calicivirus
norwalk virus
ostras
oysters
polymerase chain reaction
reação em cadeia por polimerase
são paulo sp
vírus norwalk
topic caliciviridae
calicivírus humano
human calicivirus
norwalk virus
ostras
oysters
polymerase chain reaction
reação em cadeia por polimerase
são paulo sp
vírus norwalk
description Vírus causadores de gastroenterite, descritos como pequenos vírus de estrutura arredondada (Small Round Structured Viruses-SRSV), foram detectados em extratos de ostras Crassostrea spp., coletadas em regiões distintas do litoral do Estado de São Paulo, utilizando a Reação em Cadeia por Polimerase com transcrição reversa (RT-PCR).Treze lotes de amostras, contendo 10 g de estômagos e divertículos, foram processados para extração e concentração das partículas virais, mediante adsorção-eluição e precipitação por polietilenoglicol (PEG 6000), e purificação com fluorocarbono (Freon, Dupont Co.) para eliminação prévia dos inibidores da reação de RT-PCR. A extração do ácido nucleico viral, foi realizada com uma mistura de isotiocianato de guanidina e fenol (TRIzol ®, Gibco) e clorofórmio, sendo completada com uma purificação em coluna spin, com membrana de polissulfona (Millipore,Corp.). A reação de RT-PCR foi realizada em uma única etapa, utilizando o kit \'\'Super Script ONE-STEP RT-PCR System\'\'® (Gibco). A reação de amplificação enzimática revelou, por eletroforese em gel de agarose (2%), corada com brometo de etídio, produtos de 123 bp, em 3 (23%) dos 13 lotes de amostras coletadas durante o verão de 1998, sendo verificadas em uma delas por imunomicroscopia eletrônica (IME),partículas de SRSV. Os produtos encontrados pertencem ao grupo genômico G2(Snow Mountain e outros vírus). A aplicação deste método possibilitou pela 1ª vez a detecção molecular de SRSVs no Brasil em ostras naturalmente contaminadas.
publishDate 1999
dc.date.none.fl_str_mv 1999-06-28
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13082001-143828/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13082001-143828/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1809090684568731648