Diversidade genética do HIV-1 em Indivíduos com infecção recente.

• Autor(a) principal: Gouvea, Nancy Alves de Lima
• Data de Publicação: 2003
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-09122021-121111/
• topic: Diversidade genética do HIV; Genetic diversity of HIV; HIV; HIV; HIV infection; Região V3 da GP 120

O HIV desenvolve grande diversidade genética (DV) como consequência do escape imune. Análise do HIV durante a infecção recente demonstra sequências relativamente homogêneas genotipicamente e fenotipicamente. O objetivo deste trabalho foi descrever a DV do HIV-1 entre homens vs. mulheres. Foram analisadas cinco amostras de homens e cinco de mulheres, ambos com infecção regente pelo HIV-1. Foi extraído DNA proviral e amplificado por PCR com diluição limitante final para assegurar-se que os amplicons fossem originados de uma única molécula de DNA (clone), sendo obtidos cinco clones de cada amostra. A região V3 da gp120 foi sequenciada e as sequências de nucleotídeos foram alinhadas, traduzidas em aminoácidos e feita filogenia. Foi calculada a DV intra-paciente e estimado o índice de substituições sinônimas e não sinônimas (DS/DN). Foi detectada pequena DV, confirmando a homogeneidade tanto nos homens como nas mulheres (<1%) e o valor da taxa Ds/Dn foi <1. A filogenia demonstrou segregação dos clones em determinados ramos da árvore filogenétiça. Os dados indicam que não existem importantes diferenças na população de vírus transmitidos entre mulheres e homens com relação à DV do HIV-1 na região V3 de brasileiros infectados pelo HIV-1 clade B.