Composição microbiológica cultivável do granizo de uma tempestade no sudoeste do Paraná

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Tsay, Gabriela Salles
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
Texto Completo: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/2562
Resumo: A queda de granizo é um fenômeno muito recorrente nas tempestades que atingem a Região Sul do Brasil, região do país que registra a maior incidência do fenômeno. Ainda assim, pouca investigação científica foi conduzida até o momento para se compreender as principais características do fenômeno e os mecanismos nele envolvidos. Desta forma, o presente trabalho tem como objetivo apresentar, pela primeira vez, uma caracterização da composição microbiológica cultivável do granizo de uma tempestade ocorrida no sudoeste do estado do Paraná. Após terem seus diâmetro, massa e volume mensurados fisicamente, amostras de granizo de uma tempestade ocorrida em julho de 2016 foram submetidas a um protocolo de descontaminação estabelecido neste trabalho, e cultivadas em meio MHA para o isolamento de bactérias. As UFC foram caracterizadas e contabilizadas e os 76 isolados representativos obtidos foram submetidos a análise morfotintorial com a técnica coloração de Gram. Um agrupamento fenotípico utilizando o software UPGMA permitiu a seleção de 22 isolados representativos para serem enviados ao sequenciamento genético. O DNA total destes isolados foi extraído por kit comercial e na sequência foi realizada PCR para amplificação da região 16S de RNA ribossômico (RNAr). O amplicon gerado foi encaminhado para sequenciamento em empresa especializada, e as sequências genéticas obtidas foram submetidas a buscas de similaridades com sequências gênicas presentes no GenBank, por meio do BLAST. Como resultado foram identificadas 11 espécies de bactérias pertencentes a 8 gêneros distintos, todas características de ambiente natural, com predominância de espécies em formato de bacilo, Gram-positivas e formadoras de esporos. Os gêneros Bacillus e Paenibacillus representaram 50% das espécies identificadas e foram apontados em outros estudos como potenciais nucleadores de gelo. Identificou-se ainda o gênero Sporosarcina como o único não encontrado em buscas feitas na literatura para estudos relacionados a amostras de ar, água de nuvem ou granizo. Com relação às propriedades físicas, as pedras de granizo apresentaram diâmetros médios entre 1,15 e 1,75cm, e densidades médias variando entre 0,8 a 1,0g/mL, condizentes com a literatura. Por fim, sugestões para estudos futuros foram apresentadas nas conclusões.
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spelling 2017-10-31T12:36:29Z2017-10-31T12:36:29Z2017-07-28TSAY, Gabriela Salles. Composição microbiológica cultivável do granizo de uma tempestade no sudoeste do Paraná. 2017. 72 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Ambiental) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Londrina, 2017.http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/2562A queda de granizo é um fenômeno muito recorrente nas tempestades que atingem a Região Sul do Brasil, região do país que registra a maior incidência do fenômeno. Ainda assim, pouca investigação científica foi conduzida até o momento para se compreender as principais características do fenômeno e os mecanismos nele envolvidos. Desta forma, o presente trabalho tem como objetivo apresentar, pela primeira vez, uma caracterização da composição microbiológica cultivável do granizo de uma tempestade ocorrida no sudoeste do estado do Paraná. Após terem seus diâmetro, massa e volume mensurados fisicamente, amostras de granizo de uma tempestade ocorrida em julho de 2016 foram submetidas a um protocolo de descontaminação estabelecido neste trabalho, e cultivadas em meio MHA para o isolamento de bactérias. As UFC foram caracterizadas e contabilizadas e os 76 isolados representativos obtidos foram submetidos a análise morfotintorial com a técnica coloração de Gram. Um agrupamento fenotípico utilizando o software UPGMA permitiu a seleção de 22 isolados representativos para serem enviados ao sequenciamento genético. O DNA total destes isolados foi extraído por kit comercial e na sequência foi realizada PCR para amplificação da região 16S de RNA ribossômico (RNAr). O amplicon gerado foi encaminhado para sequenciamento em empresa especializada, e as sequências genéticas obtidas foram submetidas a buscas de similaridades com sequências gênicas presentes no GenBank, por meio do BLAST. Como resultado foram identificadas 11 espécies de bactérias pertencentes a 8 gêneros distintos, todas características de ambiente natural, com predominância de espécies em formato de bacilo, Gram-positivas e formadoras de esporos. Os gêneros Bacillus e Paenibacillus representaram 50% das espécies identificadas e foram apontados em outros estudos como potenciais nucleadores de gelo. Identificou-se ainda o gênero Sporosarcina como o único não encontrado em buscas feitas na literatura para estudos relacionados a amostras de ar, água de nuvem ou granizo. Com relação às propriedades físicas, as pedras de granizo apresentaram diâmetros médios entre 1,15 e 1,75cm, e densidades médias variando entre 0,8 a 1,0g/mL, condizentes com a literatura. Por fim, sugestões para estudos futuros foram apresentadas nas conclusões.The hailfall is a recurrent phenomenon in storms that reach Brazil´s South Region. Nevertheless, little scientific investigation has been conducted in order to understand the main characteristics and involved mechanisms. Physical, chemical and microbiological characterization of hailstones consists on an important stage to understand processes associated to events that culminate in hail. Thus, this work aims to present, for the first time, a characterization of microbiological composition of hail from a hailstorm occurred in southwestern of Paraná state. Hailstones from a storm occurred in July 2016 were physically characterized (mass, diameter, volume, density), and submitted to a decontamination protocol established in this work. Melt hailstone water was plated to grow in MHA medium for bacteria isolation. We counted and characterized CFU, resulting in 76 representative isolates that were submitted to morphotintorial analysis by Gram stain technique. UPGMA software delivered a phenotypic grouping that enabled the selection of 22 representative isolates to be forwarded to the genetic sequencing service. We extracted total DNA from these isolates by commercial extraction kit and performed a PCR for amplification of ribosomal RNA (rRNA) 16S region. A specialized company provided the genetic sequences to the generated amplicon. The genetic sequences were submitted to BLAST for similarity search in GenBank. As a result, we identified 8 genera and 11 species of environmental bacteria, which were predominantly rod-shaped, Gram-positive, and spore-forming. Bacillus and Paenibacillus represented 50% of the species identified and they were mentioned in other studies as potential ice nucleators. Sporosarcina was the only genus that could not be found in our literature searches regarding air, cloud water or hail samples. Regarding the physical properties, hailstones had average diameters between 1.15 and 1.75cm, and mean densities ranging from 0.8 to 1.0g / mL, consistent with the literature. Finally, we present suggestions for future studies in the conclusion.porUniversidade Tecnológica Federal do ParanáApucaranaLondrinaPrograma de Pós-Graduação em Engenharia AmbientalUTFPRBrasilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessCNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA SANITARIAEngenharia SanitáriaCristais de geloBactériasMicro-organismosIce crystalsBacteriaMicroorganismsComposição microbiológica cultivável do granizo de uma tempestade no sudoeste do ParanáCultivable microbiological composition of hail from a Paraná state southwestern storminfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisLondrinaMartins, Jorge Albertohttp://lattes.cnpq.br/8485518379872133Furlaneto-Maia, Lucianahttp://lattes.cnpq.br/6007117281861512Martins, Jorge AlbertoPrates, Kátia Valéria Marques CardosoHallak, Ricardohttp://lattes.cnpq.br/6715476460127330Tsay, Gabriela Sallesreponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)instacron:UTFPRORIGINALLD_PPGEA_M_Tsay, Gabriela Salles_2017.pdfLD_PPGEA_M_Tsay, Gabriela Salles_2017.pdfapplication/pdf2739504http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/2562/1/LD_PPGEA_M_Tsay%2c%20Gabriela%20Salles_2017.pdf97a3a837f578c4dbe705d4c42d8300bbMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/2562/3/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81030http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/2562/2/license_rdf32b0ef966648f98b0513eb33c345c44bMD52TEXTLD_PPGEA_M_Tsay, Gabriela Salles_2017.pdf.txtLD_PPGEA_M_Tsay, Gabriela Salles_2017.pdf.txtExtracted texttext/plain144262http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/2562/4/LD_PPGEA_M_Tsay%2c%20Gabriela%20Salles_2017.pdf.txtc5481fa3f7827a1187e3e795fc92d4a6MD54THUMBNAILLD_PPGEA_M_Tsay, Gabriela Salles_2017.pdf.jpgLD_PPGEA_M_Tsay, Gabriela Salles_2017.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1223http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/2562/5/LD_PPGEA_M_Tsay%2c%20Gabriela%20Salles_2017.pdf.jpgab3a0d347549a7d5d3345d87cceb9b13MD551/25622017-10-31 10:36:29.775oai:repositorio.utfpr.edu.br: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Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.utfpr.edu.br:8080/oai/requestopendoar:2017-10-31T12:36:29Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)false
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