Obtenção de células competentes de Paenibacillus elgii AC13

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Amorim, Gabriella Cavalcante
Data de Publicação: 2019
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UCB
Texto Completo: https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/12865
Resumo: Paenibacillus é um gênero bacteriano que produz muitas moléculas bioativas, como antimicrobianos, enzimas e promotores de crescimento de plantas. Poucas espécies deste gênero foram geneticamente manipuladas para fins biotecnológicos. No presente trabalho, utilizamos o Paenibacillus elgii AC13, que apresenta atividade antimicrobiana, principalmente devido à produção de lipopeptídeos pela síntese não ribossomal. No entanto, não existem protocolos para a manipulação genética de Paenibacillus elgii. O objetivo do presente trabalho foi obter células competentes de P. elgii AC13 para transformação genética. Primeiramente, foi necessário obter marcadores de seleção para os transformantes, uma vez que esta espécie é naturalmente resistente a vários antibióticos. Neste estudo, a ampicilina, canamicina e cloranfenicol foram testados em diferentes concentrações. Dois protocolos foram então comparados para obter células eletrocompetentes para transformação. Ambos os protocolos foram otimizados e variáveis como: densidade óptica, meio de cultura, condições de incubação e solução de lavagem foram sistematicamente testadas. Os plasmídeos utilizados foram pUC19 e pAD123. A preparação destes plasmídeos foi realizada por transformação celular de Escherichia coli XL1 blue e ER2925, respectivamente. De acordo com os dados obtidos, a utilização do antibiótico canamicina é inviável como antibiótico marcador. Já os antibióticos cloranfenicol e ampicilina, demostraram o mesmo resultado e portanto, possuem o mesmo potencial de uso como antibiótico marcador. Inicialmente foi possível obter transformantes de P. elgii AC13 a partir de um dos protocolos de eletrotransformação, mas eles não foram estáveis em culturas subsequentes. Ainda é necessário realizar testes de triagem para confirmar que o plasmídeo usado na transformação foi realmente incorporado.
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spelling Barreto, Cristine ChavesCosta, Rosiane Andrade daAmorim, Gabriella Cavalcante2020-03-27T13:08:56Z2020-03-112020-03-27T13:08:56Z2019AMORIM, Gabriella Cavalcante. Obtenção de células competentes de Paenibacillus elgii AC13. 2019. 40 f. Monografia (Graduação em Ciências Biológicas) – Universidade Católica de Brasília, Brasília, 2019.https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/12865Paenibacillus é um gênero bacteriano que produz muitas moléculas bioativas, como antimicrobianos, enzimas e promotores de crescimento de plantas. Poucas espécies deste gênero foram geneticamente manipuladas para fins biotecnológicos. No presente trabalho, utilizamos o Paenibacillus elgii AC13, que apresenta atividade antimicrobiana, principalmente devido à produção de lipopeptídeos pela síntese não ribossomal. No entanto, não existem protocolos para a manipulação genética de Paenibacillus elgii. O objetivo do presente trabalho foi obter células competentes de P. elgii AC13 para transformação genética. Primeiramente, foi necessário obter marcadores de seleção para os transformantes, uma vez que esta espécie é naturalmente resistente a vários antibióticos. Neste estudo, a ampicilina, canamicina e cloranfenicol foram testados em diferentes concentrações. Dois protocolos foram então comparados para obter células eletrocompetentes para transformação. Ambos os protocolos foram otimizados e variáveis como: densidade óptica, meio de cultura, condições de incubação e solução de lavagem foram sistematicamente testadas. Os plasmídeos utilizados foram pUC19 e pAD123. A preparação destes plasmídeos foi realizada por transformação celular de Escherichia coli XL1 blue e ER2925, respectivamente. De acordo com os dados obtidos, a utilização do antibiótico canamicina é inviável como antibiótico marcador. Já os antibióticos cloranfenicol e ampicilina, demostraram o mesmo resultado e portanto, possuem o mesmo potencial de uso como antibiótico marcador. Inicialmente foi possível obter transformantes de P. elgii AC13 a partir de um dos protocolos de eletrotransformação, mas eles não foram estáveis em culturas subsequentes. Ainda é necessário realizar testes de triagem para confirmar que o plasmídeo usado na transformação foi realmente incorporado.Paenibacillus is a bacterial genus that produces many bioactive molecules, such as antimicrobials, enzymes and plant growth promoters. Few species of this genus have been genetically manipulated for future biotechnology purposes. In the present work, we used Paenibacillus elgii AC13, which shows antimicrobial activity, mainly due to the production of lipopeptides by non-ribosomal synthesis. However, there are no protocols for the genetic manipulation of Paenibacillus elgii. The objective of the present work was to obtain P. elgii AC13 competent cells for genetic transformation. First, it was necessary to obtain selection markers for the transformants, since this species is naturally resistant to various antibiotics. In this study, ampicillin, kanamycin and chloramphenicol were tested in different concentrations. Two protocols were then compared to obtain electrocompetent cells for transformation. Both protocols were optimized and variables such as: optical density, culture medium, incubation conditions and wash solution were systematically tested. The plasmids used were pUC19 and pAD123. The preparation of these plasmids was performed by cell transformation of Escherichia coli XL1 blue and ER2925, respectively. According to the data obtained, the use of the antibiotic kanamycin is not feasible as a marker antibiotic. On the other hand, the antibiotics claranfenicol and ampicillin, demonstrated the same result and therefore, have the same potential of use as antibiotic marker. Initially it was possible to obtain P. elgii AC13 transformants from one of the electrotransformation protocols, but they were not stable in subsequent cultures. Further screening tests are still required to confirm that the plasmid used in the transformation was actually incorporated.Submitted by Cláudia de Fátima Moura (claudiaf@ucb.br) on 2020-03-11T19:47:42Z No. of bitstreams: 1 GabriellaCavalcanteAmorimTCCGraduacao2019.pdf: 940563 bytes, checksum: cca337b03c93440ce664f0af37756f6e (MD5)Approved for entry into archive by Sara Ribeiro (sara.ribeiro@ucb.br) on 2020-03-27T13:08:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 GabriellaCavalcanteAmorimTCCGraduacao2019.pdf: 940563 bytes, checksum: cca337b03c93440ce664f0af37756f6e (MD5)Made available in DSpace on 2020-03-27T13:08:56Z (GMT). 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Paenibacillus is a bacterial genus that produces many bioactive molecules, such as antimicrobials, enzymes and plant growth promoters. Few species of this genus have been genetically manipulated for future biotechnology purposes. In the present work, we used Paenibacillus elgii AC13, which shows antimicrobial activity, mainly due to the production of lipopeptides by non-ribosomal synthesis. However, there are no protocols for the genetic manipulation of Paenibacillus elgii. The objective of the present work was to obtain P. elgii AC13 competent cells for genetic transformation. First, it was necessary to obtain selection markers for the transformants, since this species is naturally resistant to various antibiotics. In this study, ampicillin, kanamycin and chloramphenicol were tested in different concentrations. Two protocols were then compared to obtain electrocompetent cells for transformation. Both protocols were optimized and variables such as: optical density, culture medium, incubation conditions and wash solution were systematically tested. The plasmids used were pUC19 and pAD123. The preparation of these plasmids was performed by cell transformation of Escherichia coli XL1 blue and ER2925, respectively. According to the data obtained, the use of the antibiotic kanamycin is not feasible as a marker antibiotic. On the other hand, the antibiotics claranfenicol and ampicillin, demonstrated the same result and therefore, have the same potential of use as antibiotic marker. Initially it was possible to obtain P. elgii AC13 transformants from one of the electrotransformation protocols, but they were not stable in subsequent cultures. Further screening tests are still required to confirm that the plasmid used in the transformation was actually incorporated.
description Paenibacillus é um gênero bacteriano que produz muitas moléculas bioativas, como antimicrobianos, enzimas e promotores de crescimento de plantas. Poucas espécies deste gênero foram geneticamente manipuladas para fins biotecnológicos. No presente trabalho, utilizamos o Paenibacillus elgii AC13, que apresenta atividade antimicrobiana, principalmente devido à produção de lipopeptídeos pela síntese não ribossomal. No entanto, não existem protocolos para a manipulação genética de Paenibacillus elgii. O objetivo do presente trabalho foi obter células competentes de P. elgii AC13 para transformação genética. Primeiramente, foi necessário obter marcadores de seleção para os transformantes, uma vez que esta espécie é naturalmente resistente a vários antibióticos. Neste estudo, a ampicilina, canamicina e cloranfenicol foram testados em diferentes concentrações. Dois protocolos foram então comparados para obter células eletrocompetentes para transformação. Ambos os protocolos foram otimizados e variáveis como: densidade óptica, meio de cultura, condições de incubação e solução de lavagem foram sistematicamente testadas. Os plasmídeos utilizados foram pUC19 e pAD123. A preparação destes plasmídeos foi realizada por transformação celular de Escherichia coli XL1 blue e ER2925, respectivamente. De acordo com os dados obtidos, a utilização do antibiótico canamicina é inviável como antibiótico marcador. Já os antibióticos cloranfenicol e ampicilina, demostraram o mesmo resultado e portanto, possuem o mesmo potencial de uso como antibiótico marcador. Inicialmente foi possível obter transformantes de P. elgii AC13 a partir de um dos protocolos de eletrotransformação, mas eles não foram estáveis em culturas subsequentes. Ainda é necessário realizar testes de triagem para confirmar que o plasmídeo usado na transformação foi realmente incorporado.
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