Análise de biblioteca genômica de acidobactéria contendo genes envolvidos na degradação de celulose

• Autor(a) principal: Povoa, Robson de Oliveira
• Data de Publicação: 2017
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UCB
• Texto Completo: https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/123456789/9169
• topic: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS; Celulose; Acidobactéria

A celulose e o um dos mais abundantes biopolimeros do planeta, principal componente da parede celular dos vegetais. Devido sua característica hidrofóbica e elevado grau de interação entre as fibras, a celulose é um biopolímero de difícil degradação enzimática. Na natureza, organismos como fungos, bactérias e alguns animais, produzem celulases, enzimas capazes de degradar celulose. As celulases são bastante utilizadas nas indústrias alimentícias, farmacêuticas e biocombustíveis. As bactérias do filo Acidobacteria são amplamente distribuídas, presentes em ambientes terrestres, aquáticos e em lugares poluídos. Estudos do genoma de Acidobacterias revelaram a presença de diversos genes responsáveis pela expressão de enzimas ligadas ao metabolismo de metais, carboidratos e nitrogênio A degradação da celulose pelas Acidobacterias é descrita na literatura, essa função tem papel fundamental na ciclagem de carbono e nutrientes aprisionado na biomassa vegetal. A acidobactéria AB60 foi isolada do solo do Cerrado e tem a capacidade de degradar xilana. Em triagem realizada em trabalho anterior foram selecionados quinze clones da biblioteca genômica de AB60 com indicação de degradação de celulose. Para a confirmação da presença de genes envolvidos na degradação de celulose, sete clones foram selecionados randomicamente desse grupo de 15 clones para o presente trabalho. Estes tiveram o plasmídeo extraído e retrasnformado em Escherichia coli, no entanto, apenas quatro foram retransformados com sucesso. Os quatro clones foram avaliados em bioensaio em meio LB sólido contendo carboximetilcelulose como fonte de carbono. A coloração com corante vermelho congo revelou halos de degradação putativos no meio. Os clones que apresentaram halos putativos tiveram o plasmídeo extraído e o inserto sequenciado. As sequências do inserto foram analisados no BLASTx, revelando a presença de genes de transportadores de aminoácidos, receptor de histidina quinase e enzima N-acetil-gama-glutamil-fosfato redutase. Os genes encontrados não possuem relação com degradação de celulose. A análise dos clones mostrou não haver genes de celulase ou alguma outra enzima da família glicosil hidrosilase. A perspectiva futura para esse trabalho é realizar o mesmo procedimento para os demais clones selecionados. Além disso, poderia se realizar uma nova triagem da biblioteca usando outras fontes de celuloses além do CMC, como bagaço de cana.