AlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salino

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Raulzito Fernandes Moreira
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
Texto Completo: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=12901
Resumo: O estresse salino à apontado como tendo impactos negativos sobre a produÃÃo de cultivares de interesse comercial. Nos Ãltimos anos os estudos tÃm focado na pesquisa e no entendimento dos mecanismos utilizados pelas plantas que toleram esse tipo de estresse naturalmente. Dentre as espÃcies que toleram ao estresse salino encontra-se Anacardium occidentale L. ou popularmente conhecida como Cajueiro. Trabalhos na literatura jà descrevem mecanismos que esse cultivar pode utilizar para suportar a condiÃÃo de estresse. Contudo, estudos adicionais que permitam obter uma visÃo global do processo sÃo requeridos para um melhor entendimento das vias que estÃo envolvidas em resposta ao estresse salino no Cajueiro. O presente trabalho objetivou a avaliaÃÃo da expressÃo global de genes em folhas de Cajueiro CCP76 com base no perfil transcriptÃmico em condiÃÃes normais e de estresse. Para tanto, fez-se induÃÃo do estresse salino com 150 mM de NaCl e as coletas de folhas foram realizadas apÃs 1, 3, 6 e 12 horas da adiÃÃo do sal. O transcriptoma das folhas foi montado utilizando-se o programa Velvet. Por fim, os dados identificados pela ferramenta BLAST foram classificados com base no Gene Ontology (GO) e KEGG Pathways. Os dados obtidos foram utilizados na anÃlise comparativa entre Ãs plantas em estresse salino e o controle. Foram obtidos um total de 9.133.193 e 10.787.002 leituras para condiÃÃo controle e estresse, respectivamente. Os resultados revelaram que os contigs com coberturas maiores que 50 vezes estavam relacionados as vias de produÃÃo de aminoÃcidos, metabÃlitos secundÃrios e enzimas antioxidativas. Tais resultados mostram as mudanÃas metabÃlicas sofridas pela espÃcie em estudo para adequaÃÃo Ãs condiÃÃes de estresse. Em suma, pÃde-se observar de forma eficiente as mudanÃas globais no metabolismo do cajueiro para adaptaÃÃo a condiÃÃo de estresse. Os resultados aumentam as informaÃÃes sobre as possÃveis vias que Anacardium occidentale L. usa para tolerar a condiÃÃo de estresse, alÃm de apontarem para elucidaÃÃo de novos mecanismos usada por tal organismo. Esse à o primeiro trabalho na literatura que analisou os impactos em transcritos nas primeiras horas de estresse salino em cajueiro.
id UFC_4acfdf63a34aeb0095afed11787c6b5e
oai_identifier_str oai:www.teses.ufc.br:8693
network_acronym_str UFC
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
spelling info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisAlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salinoAlteration in profile expression of genes in CCP76 Cashew leaves (Anacardium occidentale L.) in response to salt stress2014-02-03Rodrigo Maranguape Silva da Cunha70290008387http://lattes.cnpq.br/1918056067943429Luiz Ferreira Aguiar Ponte44364687391http://lattes.cnpq.br/9493961652075640JoÃo Garcia Alves Filho00383652359http://lattes.cnpq.br/541483825079858303813324389http://lattes.cnpq.br/3999132268594031Raulzito Fernandes MoreiraUniversidade Federal do CearÃPrograma de PÃs-GraduaÃÃo em Biotecnologia (Campus da UFC em Sobral-CE)UFCBRTranscriptÃmica Estresse Salino Cajueiro FolhaTranscriptome Salt Stress Cashew LeafBIOLOGIA MOLECULARO estresse salino à apontado como tendo impactos negativos sobre a produÃÃo de cultivares de interesse comercial. Nos Ãltimos anos os estudos tÃm focado na pesquisa e no entendimento dos mecanismos utilizados pelas plantas que toleram esse tipo de estresse naturalmente. Dentre as espÃcies que toleram ao estresse salino encontra-se Anacardium occidentale L. ou popularmente conhecida como Cajueiro. Trabalhos na literatura jà descrevem mecanismos que esse cultivar pode utilizar para suportar a condiÃÃo de estresse. Contudo, estudos adicionais que permitam obter uma visÃo global do processo sÃo requeridos para um melhor entendimento das vias que estÃo envolvidas em resposta ao estresse salino no Cajueiro. O presente trabalho objetivou a avaliaÃÃo da expressÃo global de genes em folhas de Cajueiro CCP76 com base no perfil transcriptÃmico em condiÃÃes normais e de estresse. Para tanto, fez-se induÃÃo do estresse salino com 150 mM de NaCl e as coletas de folhas foram realizadas apÃs 1, 3, 6 e 12 horas da adiÃÃo do sal. O transcriptoma das folhas foi montado utilizando-se o programa Velvet. Por fim, os dados identificados pela ferramenta BLAST foram classificados com base no Gene Ontology (GO) e KEGG Pathways. Os dados obtidos foram utilizados na anÃlise comparativa entre Ãs plantas em estresse salino e o controle. Foram obtidos um total de 9.133.193 e 10.787.002 leituras para condiÃÃo controle e estresse, respectivamente. Os resultados revelaram que os contigs com coberturas maiores que 50 vezes estavam relacionados as vias de produÃÃo de aminoÃcidos, metabÃlitos secundÃrios e enzimas antioxidativas. Tais resultados mostram as mudanÃas metabÃlicas sofridas pela espÃcie em estudo para adequaÃÃo Ãs condiÃÃes de estresse. Em suma, pÃde-se observar de forma eficiente as mudanÃas globais no metabolismo do cajueiro para adaptaÃÃo a condiÃÃo de estresse. Os resultados aumentam as informaÃÃes sobre as possÃveis vias que Anacardium occidentale L. usa para tolerar a condiÃÃo de estresse, alÃm de apontarem para elucidaÃÃo de novos mecanismos usada por tal organismo. Esse à o primeiro trabalho na literatura que analisou os impactos em transcritos nas primeiras horas de estresse salino em cajueiro.Salt stress is touted as having negative impacts on the production of commercial cultivars interest. In recent years studies have focused on the research and understanding of the mechanisms used by plants to tolerate this kind of stress naturally. Among the species that tolerate salt stress is Anacardium occidentale L. or popularly known as Cashew. Studies in the literature have described the mechanisms that this cultivar can use to support the stress condition. However, additional studies to obtain an overall view of the process are required for a better understanding of the pathways that are involved in response to salt stress in Cashew. This study aimed to evaluate the global gene expression in leaves Cashew CCP76 based on transcriptomic profile in normal and stress condition. As such, there is induction of salt stress with 150 mM NaCl and collections of leaves were performed after 1, 3, 6 and 12 hours of salt addition. The leaves transcriptome assembled using the Velvet program. Finally, the data identified by the BLAST tool and were classified based on Gene Ontology (GO) and KEGG Pathways. The data were used in the comparative analysis between the plants in salt stress and control. A total of 9,133,193 and 10,787,002 reads were obtained for the control condition and stress, respectively. The results showed that contigs with covers greater than 50 times were related pathways for the production of amino acids, secondary metabolites and antioxidative enzymes. These results show metabolic changes undergone by the species under for adaptation to stress conditions. In short, it can be observed efficiently global changes in the metabolism of cashew for adaptation to stress condition. The results augment the information about possible routes that Anacardium occidentale L. uses to tolerate the stress condition, and also point to elucidate new mechanisms used by this organism. This is the first work in the literature that examined the impacts on transcripts in the early hours of salt stress on cashew.CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superiorhttp://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=12901application/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFCinstname:Universidade Federal do Cearáinstacron:UFC2019-01-21T11:26:45Zmail@mail.com -
dc.title.pt.fl_str_mv AlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salino
dc.title.alternative.en.fl_str_mv Alteration in profile expression of genes in CCP76 Cashew leaves (Anacardium occidentale L.) in response to salt stress
title AlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salino
spellingShingle AlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salino
Raulzito Fernandes Moreira
TranscriptÃmica
Estresse Salino
Cajueiro
Folha
Transcriptome
Salt Stress
Cashew
Leaf
BIOLOGIA MOLECULAR
title_short AlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salino
title_full AlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salino
title_fullStr AlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salino
title_full_unstemmed AlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salino
title_sort AlteraÃÃo no perfil de expressÃo dos genes de folhas de Cajueiro CCP76 (Anacardium occidentale L.) em resposta ao estresse salino
author Raulzito Fernandes Moreira
author_facet Raulzito Fernandes Moreira
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Rodrigo Maranguape Silva da Cunha
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv 70290008387
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1918056067943429
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Luiz Ferreira Aguiar Ponte
dc.contributor.referee1ID.fl_str_mv 44364687391
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9493961652075640
dc.contributor.referee2.fl_str_mv JoÃo Garcia Alves Filho
dc.contributor.referee2ID.fl_str_mv 00383652359
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/5414838250798583
dc.contributor.authorID.fl_str_mv 03813324389
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3999132268594031
dc.contributor.author.fl_str_mv Raulzito Fernandes Moreira
contributor_str_mv Rodrigo Maranguape Silva da Cunha
Luiz Ferreira Aguiar Ponte
JoÃo Garcia Alves Filho
dc.subject.por.fl_str_mv TranscriptÃmica
Estresse Salino
Cajueiro
Folha
topic TranscriptÃmica
Estresse Salino
Cajueiro
Folha
Transcriptome
Salt Stress
Cashew
Leaf
BIOLOGIA MOLECULAR
dc.subject.eng.fl_str_mv Transcriptome
Salt Stress
Cashew
Leaf
dc.subject.cnpq.fl_str_mv BIOLOGIA MOLECULAR
dc.description.sponsorship.fl_txt_mv CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior
dc.description.abstract.por.fl_txt_mv O estresse salino à apontado como tendo impactos negativos sobre a produÃÃo de cultivares de interesse comercial. Nos Ãltimos anos os estudos tÃm focado na pesquisa e no entendimento dos mecanismos utilizados pelas plantas que toleram esse tipo de estresse naturalmente. Dentre as espÃcies que toleram ao estresse salino encontra-se Anacardium occidentale L. ou popularmente conhecida como Cajueiro. Trabalhos na literatura jà descrevem mecanismos que esse cultivar pode utilizar para suportar a condiÃÃo de estresse. Contudo, estudos adicionais que permitam obter uma visÃo global do processo sÃo requeridos para um melhor entendimento das vias que estÃo envolvidas em resposta ao estresse salino no Cajueiro. O presente trabalho objetivou a avaliaÃÃo da expressÃo global de genes em folhas de Cajueiro CCP76 com base no perfil transcriptÃmico em condiÃÃes normais e de estresse. Para tanto, fez-se induÃÃo do estresse salino com 150 mM de NaCl e as coletas de folhas foram realizadas apÃs 1, 3, 6 e 12 horas da adiÃÃo do sal. O transcriptoma das folhas foi montado utilizando-se o programa Velvet. Por fim, os dados identificados pela ferramenta BLAST foram classificados com base no Gene Ontology (GO) e KEGG Pathways. Os dados obtidos foram utilizados na anÃlise comparativa entre Ãs plantas em estresse salino e o controle. Foram obtidos um total de 9.133.193 e 10.787.002 leituras para condiÃÃo controle e estresse, respectivamente. Os resultados revelaram que os contigs com coberturas maiores que 50 vezes estavam relacionados as vias de produÃÃo de aminoÃcidos, metabÃlitos secundÃrios e enzimas antioxidativas. Tais resultados mostram as mudanÃas metabÃlicas sofridas pela espÃcie em estudo para adequaÃÃo Ãs condiÃÃes de estresse. Em suma, pÃde-se observar de forma eficiente as mudanÃas globais no metabolismo do cajueiro para adaptaÃÃo a condiÃÃo de estresse. Os resultados aumentam as informaÃÃes sobre as possÃveis vias que Anacardium occidentale L. usa para tolerar a condiÃÃo de estresse, alÃm de apontarem para elucidaÃÃo de novos mecanismos usada por tal organismo. Esse à o primeiro trabalho na literatura que analisou os impactos em transcritos nas primeiras horas de estresse salino em cajueiro.
dc.description.abstract.eng.fl_txt_mv Salt stress is touted as having negative impacts on the production of commercial cultivars interest. In recent years studies have focused on the research and understanding of the mechanisms used by plants to tolerate this kind of stress naturally. Among the species that tolerate salt stress is Anacardium occidentale L. or popularly known as Cashew. Studies in the literature have described the mechanisms that this cultivar can use to support the stress condition. However, additional studies to obtain an overall view of the process are required for a better understanding of the pathways that are involved in response to salt stress in Cashew. This study aimed to evaluate the global gene expression in leaves Cashew CCP76 based on transcriptomic profile in normal and stress condition. As such, there is induction of salt stress with 150 mM NaCl and collections of leaves were performed after 1, 3, 6 and 12 hours of salt addition. The leaves transcriptome assembled using the Velvet program. Finally, the data identified by the BLAST tool and were classified based on Gene Ontology (GO) and KEGG Pathways. The data were used in the comparative analysis between the plants in salt stress and control. A total of 9,133,193 and 10,787,002 reads were obtained for the control condition and stress, respectively. The results showed that contigs with covers greater than 50 times were related pathways for the production of amino acids, secondary metabolites and antioxidative enzymes. These results show metabolic changes undergone by the species under for adaptation to stress conditions. In short, it can be observed efficiently global changes in the metabolism of cashew for adaptation to stress condition. The results augment the information about possible routes that Anacardium occidentale L. uses to tolerate the stress condition, and also point to elucidate new mechanisms used by this organism. This is the first work in the literature that examined the impacts on transcripts in the early hours of salt stress on cashew.
description O estresse salino à apontado como tendo impactos negativos sobre a produÃÃo de cultivares de interesse comercial. Nos Ãltimos anos os estudos tÃm focado na pesquisa e no entendimento dos mecanismos utilizados pelas plantas que toleram esse tipo de estresse naturalmente. Dentre as espÃcies que toleram ao estresse salino encontra-se Anacardium occidentale L. ou popularmente conhecida como Cajueiro. Trabalhos na literatura jà descrevem mecanismos que esse cultivar pode utilizar para suportar a condiÃÃo de estresse. Contudo, estudos adicionais que permitam obter uma visÃo global do processo sÃo requeridos para um melhor entendimento das vias que estÃo envolvidas em resposta ao estresse salino no Cajueiro. O presente trabalho objetivou a avaliaÃÃo da expressÃo global de genes em folhas de Cajueiro CCP76 com base no perfil transcriptÃmico em condiÃÃes normais e de estresse. Para tanto, fez-se induÃÃo do estresse salino com 150 mM de NaCl e as coletas de folhas foram realizadas apÃs 1, 3, 6 e 12 horas da adiÃÃo do sal. O transcriptoma das folhas foi montado utilizando-se o programa Velvet. Por fim, os dados identificados pela ferramenta BLAST foram classificados com base no Gene Ontology (GO) e KEGG Pathways. Os dados obtidos foram utilizados na anÃlise comparativa entre Ãs plantas em estresse salino e o controle. Foram obtidos um total de 9.133.193 e 10.787.002 leituras para condiÃÃo controle e estresse, respectivamente. Os resultados revelaram que os contigs com coberturas maiores que 50 vezes estavam relacionados as vias de produÃÃo de aminoÃcidos, metabÃlitos secundÃrios e enzimas antioxidativas. Tais resultados mostram as mudanÃas metabÃlicas sofridas pela espÃcie em estudo para adequaÃÃo Ãs condiÃÃes de estresse. Em suma, pÃde-se observar de forma eficiente as mudanÃas globais no metabolismo do cajueiro para adaptaÃÃo a condiÃÃo de estresse. Os resultados aumentam as informaÃÃes sobre as possÃveis vias que Anacardium occidentale L. usa para tolerar a condiÃÃo de estresse, alÃm de apontarem para elucidaÃÃo de novos mecanismos usada por tal organismo. Esse à o primeiro trabalho na literatura que analisou os impactos em transcritos nas primeiras horas de estresse salino em cajueiro.
publishDate 2014
dc.date.issued.fl_str_mv 2014-02-03
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
status_str publishedVersion
format masterThesis
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=12901
url http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=12901
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do CearÃ
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de PÃs-GraduaÃÃo em Biotecnologia (Campus da UFC em Sobral-CE)
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFC
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do CearÃ
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
instname:Universidade Federal do Ceará
instacron:UFC
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC
instname_str Universidade Federal do Ceará
instacron_str UFC
institution UFC
repository.name.fl_str_mv -
repository.mail.fl_str_mv mail@mail.com
_version_ 1643295199807406080

Registros relacionados