Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Lima, Beatriz Dias
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
Texto Completo: http://app.uff.br/riuff/handle/1/30857
Resumo: Entre os bacilos Gram-negativos (BGN), Enterobacterales, Pseudomonas aeruginosa e Acinetobacter baumannii se destacam como importantes patógenos oportunistas, especialmente no ambiente hospitalar. Esses patógenos são causas importantes de infecções associadas à assistência à saúde, tais como as da corrente sanguínea, do trato respiratório e as urinárias, relacionadas principalmente com Klebsiella pneumoniae, bem como P. aeruginosa e A. baumannii. A resistência bacteriana tem se tornado um problema de saúde pública mundial, resultando em uma maior dificuldade no tratamento de infecções, uma vez que restringe o arsenal terapêutico disponível. Nesse contexto, as polimixinas foram reintroduzidas na clínica médica, sendo considerada uma das poucas opções para o tratamento de infecções graves causadas por BGN multirresistentes. Porém, a emergência de amostras resistentes às polimixinas tem sido observada nos últimos anos. O método de referência para a detecção de resistência a polimixina é o da microdiluição em caldo, entretanto esse método é custoso e laborioso, sendo de difícil implementação na rotina laboratorial. Desta maneira, métodos fenotípicos alternativos têm sido propostos. O presente trabalho teve como objetivo a avaliação do desempenho do teste da gota (Colispot) e do sistema comercial Policimbac®, frente ao da microdiluição em caldo, entre amostras clínicas de BGN. No estudo, foram analisadas 23 amostras de bacilos Gram-negativos (16 de K. pneumoniae, três P. aeruginosa, três de A. baumannii e uma de Providencia stuartii), isoladas entre os anos de 2019 e 2023 e obtidas de diferentes materiais clínicos provenientes de pacientes assistidos em hospitais da região metropolitana do Rio de Janeiro. A confirmação da identificação das amostras foi realizada através da técnica de espectrometria de massa MALDI TOF. Os perfis de susceptibilidade frente a polimixina B foram verificados através da microdiluição em caldo e frente a beta-lactâmicos, de testes de disco-difusão. As amostras resistentes a carbapenêmicos foram submetidas aos métodos de inativação do carbapenêmico modificado (CIMm) e de inativação do carbapenêmico com EDTA (CIMe). Todas as amostras foram analisadas através do sistema comercial Policimbac® e do teste da gota, em três concentrações de colistina (4, 8 e 16 μg/mL). Foram detectadas 18 amostras resistentes à polimixina (K. pneumoniae = 12; P. aeruginosa = 3; A. baumannii = 2; P. stuartii =1) e cinco sensíveis (K. pneumoniae = 4; A. baumannii =1), de acordo com o método de microdiluição em caldo. Um total de 20 amostras (87%) apresentou resistência aos carbapenêmicos e dessas, 17 (85%) eram resistentes a polimixina. Foi obtida uma concordância categórica (CA) de 95,7%, concordância essencial (EA) de 56,5%, erro grave (ME) de 4,3% e nenhum erro muito grave (VME), nos resultados do Policimbac®. Em relação ao teste da gota, se verificou uma concordância categórica de 78,3% e de 4,3% e 17,3% de ME e VME para a concentração de 4 μg/mL; e uma concordância categórica de 65,2% e um percentual de 4,3% e de 30,4% de ME e VME, respectivamente, nos testes nas concentrações de 8 e 16μg/mL. A sensibilidade e a especificidade obtidas para os métodos alternativos utilizados foram de 100% e 83,3% para o Policimbac®, respectivamente e de 81,8% e 83,3% para o teste da gota na concentração de 4μg/mL. Para as concentrações de 8 e 16 μg/mL observou-se uma sensibilidade de 72% e especificidade de 83,3%. Os resultados demonstraram um melhor desempenho do Policimbac® em relação ao teste da gota, que apresentou percentuais de CA, ME e VME fora dos limites aceitáveis, independente da concentração de colistina utilizada
id UFF-2_51a83592dbb7a1a0e443cd2c82f9d376
oai_identifier_str oai:app.uff.br:1/30857
network_acronym_str UFF-2
network_name_str Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
repository_id_str 2120
spelling Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®Bacilos Gram-negativosResistência a polimixinasDetecção laboratorialBacilos e cocos aeróbios gram-negativosPolimixinasResistência microbiana a medicamentosTécnicas de laboratório clínicoGram-negative bacilliPolymyxin resistanceLaboratory detectionEntre os bacilos Gram-negativos (BGN), Enterobacterales, Pseudomonas aeruginosa e Acinetobacter baumannii se destacam como importantes patógenos oportunistas, especialmente no ambiente hospitalar. Esses patógenos são causas importantes de infecções associadas à assistência à saúde, tais como as da corrente sanguínea, do trato respiratório e as urinárias, relacionadas principalmente com Klebsiella pneumoniae, bem como P. aeruginosa e A. baumannii. A resistência bacteriana tem se tornado um problema de saúde pública mundial, resultando em uma maior dificuldade no tratamento de infecções, uma vez que restringe o arsenal terapêutico disponível. Nesse contexto, as polimixinas foram reintroduzidas na clínica médica, sendo considerada uma das poucas opções para o tratamento de infecções graves causadas por BGN multirresistentes. Porém, a emergência de amostras resistentes às polimixinas tem sido observada nos últimos anos. O método de referência para a detecção de resistência a polimixina é o da microdiluição em caldo, entretanto esse método é custoso e laborioso, sendo de difícil implementação na rotina laboratorial. Desta maneira, métodos fenotípicos alternativos têm sido propostos. O presente trabalho teve como objetivo a avaliação do desempenho do teste da gota (Colispot) e do sistema comercial Policimbac®, frente ao da microdiluição em caldo, entre amostras clínicas de BGN. No estudo, foram analisadas 23 amostras de bacilos Gram-negativos (16 de K. pneumoniae, três P. aeruginosa, três de A. baumannii e uma de Providencia stuartii), isoladas entre os anos de 2019 e 2023 e obtidas de diferentes materiais clínicos provenientes de pacientes assistidos em hospitais da região metropolitana do Rio de Janeiro. A confirmação da identificação das amostras foi realizada através da técnica de espectrometria de massa MALDI TOF. Os perfis de susceptibilidade frente a polimixina B foram verificados através da microdiluição em caldo e frente a beta-lactâmicos, de testes de disco-difusão. As amostras resistentes a carbapenêmicos foram submetidas aos métodos de inativação do carbapenêmico modificado (CIMm) e de inativação do carbapenêmico com EDTA (CIMe). Todas as amostras foram analisadas através do sistema comercial Policimbac® e do teste da gota, em três concentrações de colistina (4, 8 e 16 μg/mL). Foram detectadas 18 amostras resistentes à polimixina (K. pneumoniae = 12; P. aeruginosa = 3; A. baumannii = 2; P. stuartii =1) e cinco sensíveis (K. pneumoniae = 4; A. baumannii =1), de acordo com o método de microdiluição em caldo. Um total de 20 amostras (87%) apresentou resistência aos carbapenêmicos e dessas, 17 (85%) eram resistentes a polimixina. Foi obtida uma concordância categórica (CA) de 95,7%, concordância essencial (EA) de 56,5%, erro grave (ME) de 4,3% e nenhum erro muito grave (VME), nos resultados do Policimbac®. Em relação ao teste da gota, se verificou uma concordância categórica de 78,3% e de 4,3% e 17,3% de ME e VME para a concentração de 4 μg/mL; e uma concordância categórica de 65,2% e um percentual de 4,3% e de 30,4% de ME e VME, respectivamente, nos testes nas concentrações de 8 e 16μg/mL. A sensibilidade e a especificidade obtidas para os métodos alternativos utilizados foram de 100% e 83,3% para o Policimbac®, respectivamente e de 81,8% e 83,3% para o teste da gota na concentração de 4μg/mL. Para as concentrações de 8 e 16 μg/mL observou-se uma sensibilidade de 72% e especificidade de 83,3%. Os resultados demonstraram um melhor desempenho do Policimbac® em relação ao teste da gota, que apresentou percentuais de CA, ME e VME fora dos limites aceitáveis, independente da concentração de colistina utilizadaAmong Gram-negative bacilli (GNB), Enterobacterales, Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii stand out as important opportunistic pathogens, especially in the hospital environment. These pathogens are important causes of healthcare-associated infections, such as bloodstream, respiratory tract, and urinary tract infections, mainly related to Klebsiella pneumoniae, as well as P. aeruginosa and A. baumannii. Bacterial resistance has become a worldwide public health problem, resulting in increased difficulty in treating infections as it restricts the available therapeutic arsenal. In this context, polymyxins have been reintroduced in medical practice, being considered one of the few options for the treatment of severe infections caused by multidrug- resistant BGN. However, the emergence of polymyxin-resistant samples has been observed in recent years. The reference method for the detection of polymyxin resistance is broth microdilution, but this method is costly and laborious, and difficult to implement in routine laboratory practice. Thus, alternative phenotypic methods have been proposed. The aim of the present study was to evaluate the performance of the Colispot drop test and the Policimbac® commercial system, in comparison to broth microdilution among BGN clinical samples. In the study, 23 strains of Gram-negative bacilli (16 K. pneumoniae, three P. aeruginosa, three A. baumannii and one Providencia stuartii), isolated between the years 2019 to 2023 and obtained from different clinical materials from patients seen at hospitals in the metropolitan region of Rio de Janeiro, were analyzed. The identification of the samples was confirmed using the MALDI TOF mass spectrometry technique. The susceptibility profiles against polymyxin B were verified by broth microdilution and against beta-lactams, by disk-diffusion tests. The strains resistant to carbapenems were submitted to the methods of modified carbapenem inactivation (CIMm) and carbapenem inactivation with EDTA (CIMe). All strains were analyzed using the commercial Policimbac® system and the drop test at three concentrations of colistin (4, 8 and 16 μg/mL). Eighteen polymyxin resistant (K. pneumoniae = 12; P. aeruginosa = 3; A. baumannii = 2; P. stuartii =1) and five sensitive (K. pneumoniae = 4; A. baumannii =1) strains were detected according to the broth microdilution method. A total of 20 samples (87%) showed resistance to carbapenems, and of these, 17 (85%) were resistant to polymyxin. A categorical agreement (CA) of 95.7%, essential agreement (EA) of 56.5%, 4.3% of major errors (ME) and no very major errors (VME) were obtained in the results of the Policimbac® Regarding the drop test, there was a categorical agreement of 78.3% and 4.3% and 17.3% of ME and VME for the concentration of 4μg/mL; and a categorical agreement of 65.2% and a percentage of 4.3% and 30.4%, respectively of ME and VME, in the tests in concentrations of 8 and 16μg/mL. The sensitivity and specificity obtained for the alternative methods used were 100% and 83.3% for Policimbac®, respectively, and 81.8% and 83.3% for the drop test at the 4μg/mL concentration. For the concentrations of 8 and 16 μg/mL a sensitivity of 72% and specificity of 83.3% were observed. The results showed a better performance of Policimbac® in relation to the drop test, which presented percentages of CA, ME and VME outside acceptable limits, regardless of the concentration of colistin used66 f.Souza, Cláudia Rezende Vieira de Mendonçahttp://lattes.cnpq.br/9742270645420446Chagas, Thiago Pavoni Gomeshttp://lattes.cnpq.br/6666508861219415Rebello, Nathalia de Arruda Costa CamachoSantos, André Luís dosLima, Beatriz Dias2023-10-19T18:33:39Z2023-10-19T18:33:39Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfhttp://app.uff.br/riuff/handle/1/30857CC-BY-SAinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)instacron:UFF2023-10-19T18:33:43Zoai:app.uff.br:1/30857Repositório InstitucionalPUBhttps://app.uff.br/oai/requestriuff@id.uff.bropendoar:21202023-10-19T18:33:43Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)false
dc.title.none.fl_str_mv Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®
title Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®
spellingShingle Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®
Lima, Beatriz Dias
Bacilos Gram-negativos
Resistência a polimixinas
Detecção laboratorial
Bacilos e cocos aeróbios gram-negativos
Polimixinas
Resistência microbiana a medicamentos
Técnicas de laboratório clínico
Gram-negative bacilli
Polymyxin resistance
Laboratory detection
title_short Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®
title_full Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®
title_fullStr Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®
title_full_unstemmed Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®
title_sort Detecção da resistência a polimixinas entre amostras clínicas de bacilos gram-negativos através do teste da gota e do sistema comercial Policimbac®
author Lima, Beatriz Dias
author_facet Lima, Beatriz Dias
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Souza, Cláudia Rezende Vieira de Mendonça
http://lattes.cnpq.br/9742270645420446
Chagas, Thiago Pavoni Gomes
http://lattes.cnpq.br/6666508861219415
Rebello, Nathalia de Arruda Costa Camacho
Santos, André Luís dos
dc.contributor.author.fl_str_mv Lima, Beatriz Dias
dc.subject.por.fl_str_mv Bacilos Gram-negativos
Resistência a polimixinas
Detecção laboratorial
Bacilos e cocos aeróbios gram-negativos
Polimixinas
Resistência microbiana a medicamentos
Técnicas de laboratório clínico
Gram-negative bacilli
Polymyxin resistance
Laboratory detection
topic Bacilos Gram-negativos
Resistência a polimixinas
Detecção laboratorial
Bacilos e cocos aeróbios gram-negativos
Polimixinas
Resistência microbiana a medicamentos
Técnicas de laboratório clínico
Gram-negative bacilli
Polymyxin resistance
Laboratory detection
description Entre os bacilos Gram-negativos (BGN), Enterobacterales, Pseudomonas aeruginosa e Acinetobacter baumannii se destacam como importantes patógenos oportunistas, especialmente no ambiente hospitalar. Esses patógenos são causas importantes de infecções associadas à assistência à saúde, tais como as da corrente sanguínea, do trato respiratório e as urinárias, relacionadas principalmente com Klebsiella pneumoniae, bem como P. aeruginosa e A. baumannii. A resistência bacteriana tem se tornado um problema de saúde pública mundial, resultando em uma maior dificuldade no tratamento de infecções, uma vez que restringe o arsenal terapêutico disponível. Nesse contexto, as polimixinas foram reintroduzidas na clínica médica, sendo considerada uma das poucas opções para o tratamento de infecções graves causadas por BGN multirresistentes. Porém, a emergência de amostras resistentes às polimixinas tem sido observada nos últimos anos. O método de referência para a detecção de resistência a polimixina é o da microdiluição em caldo, entretanto esse método é custoso e laborioso, sendo de difícil implementação na rotina laboratorial. Desta maneira, métodos fenotípicos alternativos têm sido propostos. O presente trabalho teve como objetivo a avaliação do desempenho do teste da gota (Colispot) e do sistema comercial Policimbac®, frente ao da microdiluição em caldo, entre amostras clínicas de BGN. No estudo, foram analisadas 23 amostras de bacilos Gram-negativos (16 de K. pneumoniae, três P. aeruginosa, três de A. baumannii e uma de Providencia stuartii), isoladas entre os anos de 2019 e 2023 e obtidas de diferentes materiais clínicos provenientes de pacientes assistidos em hospitais da região metropolitana do Rio de Janeiro. A confirmação da identificação das amostras foi realizada através da técnica de espectrometria de massa MALDI TOF. Os perfis de susceptibilidade frente a polimixina B foram verificados através da microdiluição em caldo e frente a beta-lactâmicos, de testes de disco-difusão. As amostras resistentes a carbapenêmicos foram submetidas aos métodos de inativação do carbapenêmico modificado (CIMm) e de inativação do carbapenêmico com EDTA (CIMe). Todas as amostras foram analisadas através do sistema comercial Policimbac® e do teste da gota, em três concentrações de colistina (4, 8 e 16 μg/mL). Foram detectadas 18 amostras resistentes à polimixina (K. pneumoniae = 12; P. aeruginosa = 3; A. baumannii = 2; P. stuartii =1) e cinco sensíveis (K. pneumoniae = 4; A. baumannii =1), de acordo com o método de microdiluição em caldo. Um total de 20 amostras (87%) apresentou resistência aos carbapenêmicos e dessas, 17 (85%) eram resistentes a polimixina. Foi obtida uma concordância categórica (CA) de 95,7%, concordância essencial (EA) de 56,5%, erro grave (ME) de 4,3% e nenhum erro muito grave (VME), nos resultados do Policimbac®. Em relação ao teste da gota, se verificou uma concordância categórica de 78,3% e de 4,3% e 17,3% de ME e VME para a concentração de 4 μg/mL; e uma concordância categórica de 65,2% e um percentual de 4,3% e de 30,4% de ME e VME, respectivamente, nos testes nas concentrações de 8 e 16μg/mL. A sensibilidade e a especificidade obtidas para os métodos alternativos utilizados foram de 100% e 83,3% para o Policimbac®, respectivamente e de 81,8% e 83,3% para o teste da gota na concentração de 4μg/mL. Para as concentrações de 8 e 16 μg/mL observou-se uma sensibilidade de 72% e especificidade de 83,3%. Os resultados demonstraram um melhor desempenho do Policimbac® em relação ao teste da gota, que apresentou percentuais de CA, ME e VME fora dos limites aceitáveis, independente da concentração de colistina utilizada
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-10-19T18:33:39Z
2023-10-19T18:33:39Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://app.uff.br/riuff/handle/1/30857
url http://app.uff.br/riuff/handle/1/30857
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv CC-BY-SA
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv CC-BY-SA
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
instname:Universidade Federal Fluminense (UFF)
instacron:UFF
instname_str Universidade Federal Fluminense (UFF)
instacron_str UFF
institution UFF
reponame_str Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
collection Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da Universidade Federal Fluminense (RIUFF) - Universidade Federal Fluminense (UFF)
repository.mail.fl_str_mv riuff@id.uff.br
_version_ 1802135264823345152