Diversidade de Phytophthora parasitica isolados de Citrus usando seqüências de nucleotídeos da região ITS-5.8S rDNA
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2006 |
Outros Autores: | , , |
Tipo de documento: | Artigo de conferência |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://dx.doi.org/10.1590/S0100-54052006000200017 http://hdl.handle.net/11449/5693 |
Resumo: | Realizou-se estudo para caracterização e verificação da diversidade genética de Phytophthora parasitica, agente causador da gomose dos citros. Quatorze isolados de Phytophthora parasitica, provenientes do Estado de São Paulo, foram seqüenciados a partir das regiões internas transcritas (ITS1 e ITS2) do gene 5.8S. Obtiveram-se seqüências de 812 pb a 860 pb que foram comparadas com seqüências de outras espécies de Phytophthora spp depositadas no NCBI. Foram feitos estudos filogenéticos, utilizando-se o método neighbor-joining com 1000 bootstrap e construído o dendrograma mais representativo. Obtiveram-se os resultados de 98,88% a 100% de similaridade genética entre os 14 isolados paulistas, e 99,5% a 98,8% entre estes e a seqüência de P. nicotianae (gi| 8927482) obtida do GenBank NCBI. |
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Diversidade de Phytophthora parasitica isolados de Citrus usando seqüências de nucleotídeos da região ITS-5.8S rDNAGenotypic diversity among P. parasitica isolates reveled by ITS-5.8S rDNA nucleotide sequencesDNA ribossomalITSFilogeniacitrus gummosisITSPhylogeneticRibosomal DNARealizou-se estudo para caracterização e verificação da diversidade genética de Phytophthora parasitica, agente causador da gomose dos citros. Quatorze isolados de Phytophthora parasitica, provenientes do Estado de São Paulo, foram seqüenciados a partir das regiões internas transcritas (ITS1 e ITS2) do gene 5.8S. Obtiveram-se seqüências de 812 pb a 860 pb que foram comparadas com seqüências de outras espécies de Phytophthora spp depositadas no NCBI. Foram feitos estudos filogenéticos, utilizando-se o método neighbor-joining com 1000 bootstrap e construído o dendrograma mais representativo. Obtiveram-se os resultados de 98,88% a 100% de similaridade genética entre os 14 isolados paulistas, e 99,5% a 98,8% entre estes e a seqüência de P. nicotianae (gi| 8927482) obtida do GenBank NCBI.Phytophthoraparasitica is been considered one of the most prevalent citrus soilborn pathogens in Brazil. Fourteen isolates were collected in different region of São Paulo state. Amplification of the ITS region using primers ITS1 and ITS2 produced DNA fragments of 812 to 860 bp, that were compared with other sequences obtained to Gene Bank (NCBI). Neighbor-joining analysis, with 1000 bootstrap revealed an average similarity of 99,3 to 100% between the isolates, and 98,1 to 99,9% between S. Paulo state isolates and P. nicotianae (= Phytophthoraparasitica)obtained from the Gene Bank (gi|8927482). The ITS1 was more conserved than to the ITS2. This is a good tool for quick diagnosis of Phytophthora citrus diseases.ESALQ/USP Depto. de Entomologia, Fitopatologia e Zoologia Agrícola Setor de FitopatologiaUniversidade Estadual Paulista FCA Departamento de Produção VegetalCentro Avançado de Pesquisa Tecnológica do Agronegócio de Citros Sylvio MoreiraUniversidade Estadual Paulista FCA Departamento de Produção VegetalGrupo Paulista de FitopatologiaUniversidade de São Paulo (USP)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Centro Avançado de Pesquisa Tecnológica do Agronegócio de Citros Sylvio MoreiraRosa, Daniel DiasMachado, Marcos AntonioTargon, Maria Luisa Penteado NatividadeFurtado, Edson Luiz [UNESP]2014-05-20T13:20:25Z2014-05-20T13:20:25Z2006-06-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/conferenceObject188-191application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-54052006000200017Summa Phytopathologica. Grupo Paulista de Fitopatologia, v. 32, n. 2, p. 188-191, 2006.0100-5405http://hdl.handle.net/11449/569310.1590/S0100-54052006000200017S0100-54052006000200017S0100-54052006000200017.pdf38459894858333950000-0002-6924-835XSciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporSumma Phytopathologica0,258info:eu-repo/semantics/openAccess2024-04-30T16:00:07Zoai:repositorio.unesp.br:11449/5693Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-06T00:05:48.505103Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
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