Os efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophila

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Mombach, Daniela Moreira
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/250273
Resumo: A Cisplatina é amplamente usada em tratamentos para o câncer e é um dos melhores agentes citostáticos disponíveis para terapia antitumoral. Drosophila melanogaster tem uma das melhores anotações de genoma e de sequências de Elementos Transponíveis (TEs). O organismo-modelo é útil para analisar o modo de ação de diversos compostos in vivo e avaliar as consequências biológicas e comportamentais dos tratamentos. O objetivo do nosso estudo foi ampliar o conhecimento dos efeitos da Cisplatina em Drosophila através do sequenciamento de RNA (RNA-seq) juntamente com ensaios biológicos. O RNA-seq foi seguido por análises de expressão diferencial de genes (DEGs) e TEs (DETEs) e de vias e termos de ontologia. Os DETEs foram confirmados por qPCR. A Cisplatina foi avaliada a 50 e 100 μg/mL no meio de cultivo de Drosophila por 24 h. As análises de locomoção, sobrevivência, oviposição e desenvolvimento foram usadas como ensaios biológicos. A Cisplatina induz DEGs de forma dose-dependente e quatro TEs foram up-regulados. A maioria dos DEGs está ligada a dano de DNA e processos de detoxificação. A Cisplatina aumenta a atividade locomotora de Drosophila e interrompe o desenvolvimento. Genes e processos relacionados aos ensaios também foram identificados. Esse é o primeiro estudo a avaliar os efeitos da Cisplatina em moscas usando RNA-seq de nosso conhecimento. A alteração na expressão gênica foi limitada, preponderantemente, ao metabolismo de droga e de dano ao DNA, a droga aparenta não afetar amplamente a Drosophila na parte molecular. Ao contrário da hipótese de que o estresse altera dramaticamente a mobilização de TEs, apenas quatro foram up-regulados. O nosso estudo, juntamente com o conhecimento prévio, confirma a Drosophila como um organismo de relevância para o estudo com quimioterápicos.
id URGS_b740cd09b57739dc6f295c9e45755bb1
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/250273
network_acronym_str URGS
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
repository_id_str 1853
spelling Mombach, Daniela MoreiraLoreto, Élgion Lúcio da Silva2022-10-25T04:54:36Z2021http://hdl.handle.net/10183/250273001142638A Cisplatina é amplamente usada em tratamentos para o câncer e é um dos melhores agentes citostáticos disponíveis para terapia antitumoral. Drosophila melanogaster tem uma das melhores anotações de genoma e de sequências de Elementos Transponíveis (TEs). O organismo-modelo é útil para analisar o modo de ação de diversos compostos in vivo e avaliar as consequências biológicas e comportamentais dos tratamentos. O objetivo do nosso estudo foi ampliar o conhecimento dos efeitos da Cisplatina em Drosophila através do sequenciamento de RNA (RNA-seq) juntamente com ensaios biológicos. O RNA-seq foi seguido por análises de expressão diferencial de genes (DEGs) e TEs (DETEs) e de vias e termos de ontologia. Os DETEs foram confirmados por qPCR. A Cisplatina foi avaliada a 50 e 100 μg/mL no meio de cultivo de Drosophila por 24 h. As análises de locomoção, sobrevivência, oviposição e desenvolvimento foram usadas como ensaios biológicos. A Cisplatina induz DEGs de forma dose-dependente e quatro TEs foram up-regulados. A maioria dos DEGs está ligada a dano de DNA e processos de detoxificação. A Cisplatina aumenta a atividade locomotora de Drosophila e interrompe o desenvolvimento. Genes e processos relacionados aos ensaios também foram identificados. Esse é o primeiro estudo a avaliar os efeitos da Cisplatina em moscas usando RNA-seq de nosso conhecimento. A alteração na expressão gênica foi limitada, preponderantemente, ao metabolismo de droga e de dano ao DNA, a droga aparenta não afetar amplamente a Drosophila na parte molecular. Ao contrário da hipótese de que o estresse altera dramaticamente a mobilização de TEs, apenas quatro foram up-regulados. O nosso estudo, juntamente com o conhecimento prévio, confirma a Drosophila como um organismo de relevância para o estudo com quimioterápicos.Cisplatin is widely used in cancer treatment and is one of the best cytostatic agents available for antitumor therapy. Drosophila melanogaster has one of the best annotated genomes and one of the best characterized sets of transposable elements (TE) sequences. This model organism is useful for analysing the mode of action of several compounds in vivo and evaluating the behavioral consequences of treatments. The aim of our study was to increase the knowledge about the effects of Cisplatin in Drosophila by joining RNA sequencing (RNA-seq) and biological assays. RNA-seq was followed by analyses of differential expression of genes (DEGs) and TEs (DETEs), and of pathways and ontology terms. DETEs were confirmed by qPCR. Cisplatin was evaluated at 50 and 100 μg/mL in Drosophila culture medium for 24 h. The fly locomotor assay, survival analysis, oviposition and development were used as biological assays. Cisplatin induced DEGs in a dose-dependent fashion, and four TEs were up-regulated. Most DEGs are related to DNA damage and detoxification processes. Cisplatin increases Drosophila locomotor activity and interrupts development. Genes and processes related to the assays were also identified. To our knowledge, this is the first study to evaluate the effects of Cisplatin in flies using RNA-seq. Gene alteration was almost limited to drug metabolism and DNA damage, and the drug did not vastly affect Drosophila on the molecular level. Contrary to the hypothesis that stress dramatically alters TEs mobilization, only four TEs were up-regulated. Our study, together with previous knowledge, asserts Drosophila as a valuable organism in the study of chemotherapy drugs.application/pdfporRNA-SeqDrosophilaElementos de DNA transponíveisCisplatinOs efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophilainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de BiociênciasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia MolecularPorto Alegre, BR-RS2021mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT001142638.pdf.txt001142638.pdf.txtExtracted Texttext/plain91116http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/250273/2/001142638.pdf.txt01766f6ca30fdd53a13a5e02c5fd261dMD52ORIGINAL001142638.pdfTexto completoapplication/pdf2245549http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/250273/1/001142638.pdf45b70de061c0196095cd15cf758ab6d8MD5110183/2502732022-10-26 04:49:52.648287oai:www.lume.ufrgs.br:10183/250273Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532022-10-26T07:49:52Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Os efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophila
title Os efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophila
spellingShingle Os efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophila
Mombach, Daniela Moreira
RNA-Seq
Drosophila
Elementos de DNA transponíveis
Cisplatin
title_short Os efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophila
title_full Os efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophila
title_fullStr Os efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophila
title_full_unstemmed Os efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophila
title_sort Os efeitos moleculares e biológicos da cisplatina em Drosophila
author Mombach, Daniela Moreira
author_facet Mombach, Daniela Moreira
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Mombach, Daniela Moreira
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Loreto, Élgion Lúcio da Silva
contributor_str_mv Loreto, Élgion Lúcio da Silva
dc.subject.por.fl_str_mv RNA-Seq
Drosophila
Elementos de DNA transponíveis
topic RNA-Seq
Drosophila
Elementos de DNA transponíveis
Cisplatin
dc.subject.eng.fl_str_mv Cisplatin
description A Cisplatina é amplamente usada em tratamentos para o câncer e é um dos melhores agentes citostáticos disponíveis para terapia antitumoral. Drosophila melanogaster tem uma das melhores anotações de genoma e de sequências de Elementos Transponíveis (TEs). O organismo-modelo é útil para analisar o modo de ação de diversos compostos in vivo e avaliar as consequências biológicas e comportamentais dos tratamentos. O objetivo do nosso estudo foi ampliar o conhecimento dos efeitos da Cisplatina em Drosophila através do sequenciamento de RNA (RNA-seq) juntamente com ensaios biológicos. O RNA-seq foi seguido por análises de expressão diferencial de genes (DEGs) e TEs (DETEs) e de vias e termos de ontologia. Os DETEs foram confirmados por qPCR. A Cisplatina foi avaliada a 50 e 100 μg/mL no meio de cultivo de Drosophila por 24 h. As análises de locomoção, sobrevivência, oviposição e desenvolvimento foram usadas como ensaios biológicos. A Cisplatina induz DEGs de forma dose-dependente e quatro TEs foram up-regulados. A maioria dos DEGs está ligada a dano de DNA e processos de detoxificação. A Cisplatina aumenta a atividade locomotora de Drosophila e interrompe o desenvolvimento. Genes e processos relacionados aos ensaios também foram identificados. Esse é o primeiro estudo a avaliar os efeitos da Cisplatina em moscas usando RNA-seq de nosso conhecimento. A alteração na expressão gênica foi limitada, preponderantemente, ao metabolismo de droga e de dano ao DNA, a droga aparenta não afetar amplamente a Drosophila na parte molecular. Ao contrário da hipótese de que o estresse altera dramaticamente a mobilização de TEs, apenas quatro foram up-regulados. O nosso estudo, juntamente com o conhecimento prévio, confirma a Drosophila como um organismo de relevância para o estudo com quimioterápicos.
publishDate 2021
dc.date.issued.fl_str_mv 2021
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-10-25T04:54:36Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/250273
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 001142638
url http://hdl.handle.net/10183/250273
identifier_str_mv 001142638
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/250273/2/001142638.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/250273/1/001142638.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 01766f6ca30fdd53a13a5e02c5fd261d
45b70de061c0196095cd15cf758ab6d8
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv lume@ufrgs.br||lume@ufrgs.br
_version_ 1810085600092487680